PPARD

PPARD
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1GWX, 1Y0S, 2AWH, 2B50, 2BAW, 2ENV, 2GWX, 2J14, 2Q5G, 2XYJ, 2XYW, 2XYX, 2ZNP, 2ZNQ, 3D5F, 3DY6, 3ET2, 3GWX, 3GZ9, 3OZ0, 3PEQ, 3SP9, 3TKM

Ідентифікатори
Символи PPARD, FAAR, NR1C2, NUC1, NUCI, NUCII, PPARB, peroxisome proliferator activated receptor delta
Зовнішні ІД OMIM: 600409 MGI: 101884 HomoloGene: 4544 GeneCards: PPARD
Пов'язані генетичні захворювання
цукровий діабет 2-го типу, diabetic cataract[1]
Реагує на сполуку
GW0742X, GW-501516, третиноїн, elafibranor, sodelglitazar, indeglitazar[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

sequence-specific DNA binding
GO:0001105 transcription coactivator activity
zinc ion binding
зв'язування з іоном металу
steroid hormone receptor activity
fatty acid binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
linoleic acid binding
protein heterodimerization activity
lipid binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
transcription factor binding
GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity
DNA binding
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
NF-kappaB binding
GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
nuclear receptor coactivator activity
signaling receptor activity

Клітинна компонента

нуклеоплазма
клітинне ядро
RNA polymerase II transcription regulator complex

Біологічний процес

fatty acid catabolic process
positive regulation of myoblast proliferation
positive regulation of epidermis development
диференціація клітин
negative regulation of smooth muscle cell proliferation
negative regulation of myoblast differentiation
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
placenta development
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of smooth muscle cell migration
Загоєння ран
mRNA transcription
cholesterol metabolic process
negative regulation of apoptotic process
response to glucose
response to activity
response to organic substance
generation of precursor metabolites and energy
regulation of fat cell differentiation
transcription, DNA-templated
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
response to vitamin A
heart development
cell-substrate adhesion
keratinocyte proliferation
GO:1901313 positive regulation of gene expression
proteoglycan metabolic process
regulation of cell population proliferation
negative regulation of cell growth
fatty acid oxidation
positive regulation of cell population proliferation
glucose metabolic process
phospholipid biosynthetic process
negative regulation of epithelial cell proliferation
positive regulation of skeletal muscle tissue regeneration
apoptotic signaling pathway
vitamin A metabolic process
positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling
keratinocyte migration
adipose tissue development
transcription initiation from RNA polymerase II promoter
regulation of skeletal muscle satellite cell proliferation
positive regulation of fat cell differentiation
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
negative regulation of inflammatory response
cellular response to lipopolysaccharide
cellular response to hypoxia
negative regulation of collagen biosynthetic process
positive regulation of insulin secretion
steroid hormone mediated signaling pathway
GO:0097285 апоптоз
проліферація
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
intracellular receptor signaling pathway
axon ensheathment
decidualization
fatty acid transport
embryo implantation
negative regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II
lipid metabolism
fatty acid beta-oxidation
glucose transmembrane transport
fatty acid metabolic process
multicellular organism development
hormone-mediated signaling pathway
negative regulation of cholesterol storage
regulation of lipid metabolic process
response to lipid
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
5467
19015
Ensembl
ENSG00000112033
ENSMUSG00000002250
UniProt
Q03181
P35396
RefSeq (мРНК)
NM_001171818
NM_001171819
NM_001171820
NM_006238
NM_177435
NM_011145
RefSeq (білок)
NP_001165289
NP_001165290
NP_001165291
NP_006229
NP_803184
NP_035275
Локус (UCSC) Хр. 6: 35.34 – 35.43 Mb Хр. 17: 28.23 – 28.3 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

PPARD (англ. Peroxisome proliferator activated receptor delta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 441 амінокислот, а молекулярна маса — 49 903[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEQPQEEAPEVREEEEKEEVAEAEGAPELNGGPQHALPSSSYTDLSRSSS
PPSLLDQLQMGCDGASCGSLNMECRVCGDKASGFHYGVHACEGCKGFFRR
TIRMKLEYEKCERSCKIQKKNRNKCQYCRFQKCLALGMSHNAIRFGRMPE
AEKRKLVAGLTANEGSQYNPQVADLKAFSKHIYNAYLKNFNMTKKKARSI
LTGKASHTAPFVIHDIETLWQAEKGLVWKQLVNGLPPYKEISVHVFYRCQ
CTTVETVRELTEFAKSIPSFSSLFLNDQVTLLKYGVHEAIFAMLASIVNK
DGLLVANGSGFVTREFLRSLRKPFSDIIEPKFEFAVKFNALELDDSDLAL
FIAAIILCGDRPGLMNVPRVEAIQDTILRALEFHLQANHPDAQYLFPKLL
QKMADLRQLVTEHAQMMQRIKKTETETSLHPLLQEIYKDMY

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Kobayashi T., Kodani Y., Nozawa A., Endo Y., Sawasaki T. (2008). DNA-binding profiling of human hormone nuclear receptors via fluorescence correlation spectroscopy in a cell-free system. FEBS Lett. 582: 2737—2744. PMID 18619963 DOI:10.1016/j.febslet.2008.07.003
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з PPARD переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Peroxisome proliferator activated receptor delta переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9235 (англ.) . Архів оригіналу за 10 травня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
  6. UniProt, Q03181 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 6
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші