HSF2

HSF2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

5D8K, 5D8L

Ідентифікатори
Символи HSF2, HSF 2, HSTF 2, heat shock transcription factor 2
Зовнішні ІД OMIM: 140581 MGI: 96239 HomoloGene: 37931 GeneCards: HSF2
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
RNA polymerase II intronic transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
DNA binding
sequence-specific DNA binding
protein homodimerization activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001105 transcription coactivator activity
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

клітинне ядро
цитоплазма
нуклеоплазма

Біологічний процес

GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription by RNA polymerase II
Сперматогенез
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription, DNA-templated
cellular response to heat
positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to heat stress

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3298
15500
Ensembl
ENSG00000025156
ENSMUSG00000019878
UniProt
Q03933
Q9BS48
P38533
RefSeq (мРНК)
NM_004506
NM_001135564
NM_001243094
NM_008297
RefSeq (білок)
NP_001129036
NP_001230023
NP_004497
NP_001230023.1
NP_032323
Локус (UCSC) Хр. 6: 122.4 – 122.43 Mb Хр. 10: 57.36 – 57.39 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

HSF2 (англ. Heat shock transcription factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 536 амінокислот, а молекулярна маса — 60 348[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MKQSSNVPAFLSKLWTLVEETHTNEFITWSQNGQSFLVLDEQRFAKEILP
KYFKHNNMASFVRQLNMYGFRKVVHIDSGIVKQERDGPVEFQHPYFKQGQ
DDLLENIKRKVSSSKPEENKIRQEDLTKIISSAQKVQIKQETIESRLSEL
KSENESLWKEVSELRAKHAQQQQVIRKIVQFIVTLVQNNQLVSLKRKRPL
LLNTNGAQKKNLFQHIVKEPTDNHHHKVPHSRTEGLKPRERISDDIIIYD
VTDDNADEENIPVIPETNEDVISDPSNCSQYPDIVIVEDDNEDEYAPVIQ
SGEQNEPARESLSSGSDGSSPLMSSAVQLNGSSSLTSEDPVTMMDSILND
NINLLGKVELLDYLDSIDCSLEDFQAMLSGRQFSIDPDLLVDLFTSSVQM
NPTDYINNTKSENKGLETTKNNVVQPVSEEGRKSKSKPDKQLIQYTAFPL
LAFLDGNPASSVEQASTTASSEVLSSVDKPIEVDELLDSSLDPEPTQSKL
VRLEPLTEAEASEATLFYLCELAPAPLDSDMPLLDS

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як відповідь на стрес, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Schuetz T.J., Gallo G.J., Sheldon L., Tempst P., Kingston R.E. (1991). Isolation of a cDNA for HSF2: evidence for two heat shock factor genes in humans. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 6911—6915. PMID 1871106 DOI:10.1073/pnas.88.16.6911
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Sheldon L., Kingston R.E. (1993). Hydrophobic coiled-coil domains regulate the subcellular localization of human heat shock factor 2. Genes Dev. 7: 1549—1558. PMID 8339932 DOI:10.1101/gad.7.8.1549
  • Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5225 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
  4. UniProt, Q03933 (англ.) . Архів оригіналу за 14 березня 2018. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 6
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші