TNNT1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TNNT1, ANM, NEM5, STNT, TNT, TNTS, troponin T1, slow skeletal type |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 191041 MGI: 1333868 HomoloGene: 20704 GeneCards: TNNT1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
nemaline myopathy 5[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • troponin T binding • tropomyosin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium ion binding • calcium-dependent ATPase activity |
---|
Клітинна компонента | • гіалоплазма • Тропонін |
---|
Біологічний процес | • regulation of muscle contraction • skeletal muscle contraction • slow-twitch skeletal muscle fiber contraction • negative regulation of muscle contraction • transition between fast and slow fiber • muscle filament sliding • м'язове скорочення • sarcomere organization • cardiac muscle contraction |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001126132 NM_001126133 NM_001291774 NM_003283 |
| | NM_001277903 NM_001277904 NM_011618 NM_001360154 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001119604 NP_001119605 NP_001278703 NP_003274 |
| | NP_001264832 NP_001264833 NP_035748 NP_001347083 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 55.13 – 55.15 Mb | Хр. 7: 4.51 – 4.52 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TNNT1 (англ. Troponin T1, slow skeletal type) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 278 амінокислот, а молекулярна маса — 32 948[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSDTEEQEYE | | EEQPEEEAAE | | EEEEAPEEPE | | PVAEPEEERP | | KPSRPVVPPL |
IPPKIPEGER | | VDFDDIHRKR | | MEKDLLELQT | | LIDVHFEQRK | | KEEEELVALK |
ERIERRRSER | | AEQQRFRTEK | | ERERQAKLAE | | EKMRKEEEEA | | KKRAEDDAKK |
KKVLSNMGAH | | FGGYLVKAEQ | | KRGKRQTGRE | | MKVRILSERK | | KPLDIDYMGE |
EQLRARSAWL | | PPSQPSCPAR | | EKAQELSDWI | | HQLESEKFDL | | MAKLKQQKYE |
INVLYNRISH | | AQKFRKGAGK | | GRVGGRWK |
Кодований геном білок за функціями належить до м'язових білків, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Gahlmann R., Troutt A.B., Wade R.P., Gunning P., Kedes L. (1987). Alternative splicing generates variants in important functional domains of human slow skeletal troponin T. J. Biol. Chem. 262: 16122—16126. PMID 2824479
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TNNT1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11948 (англ.) . Архів оригіналу за 2 квітня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P13805 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Людські | Мікрофіламенти та актин-зв'язуючі білки | Міофіламенти | Актин | |
---|
Міозин | - I
- II
- III
- V
- VI
- VII
- IX
- X
- XV
- XVIII
- Легкий ланцюг міозину
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Проміжні філаменти | Тип 1/2 (Кератин, Цитокератин) | Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини) | - тип I/хромосома 17
- хромосома 12
- інші
|
---|
Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини) | |
---|
Незгруповані альфа | |
---|
Не-альфа | |
---|
|
---|
Тип 3 | |
---|
Тип 4 | - Інтернексин
- Нестин
- Нейрофіламент
- Синемін
- Синкоїлін
|
---|
Тип 5 | |
---|
|
---|
Мікротрубочки та пов'язані білки | |
---|
Катеніни | |
---|
Мембранні | |
---|
Інші | |
---|
|
---|
Нелюдські | |
---|