Em 2000, ele começou sua carreira na Fórmula 3 com a Asiatech antes de entrar na Fórmula 1, trabalhando para a Arrows em 2001. Ele mudou para a Minardi no ano seguinte como engenheiro de corrida. Quando a equipe foi adquirida pela fabricante austríaca de bebidas energéticasRed Bull no final de 2005 e renomeada para Scuderia Toro Rosso, Mekies foi promovido a engenheiro-chefe da equipe, ficando responsável por todas as operações na pista, desde a construção do carro na fábrica até a equipe de corrida na pista. Posteriormente, ele se tornou chefe de desempenho de veículos, gerenciando seis departamentos que trabalhavam essencialmente no desempenho de carros.[4][5]
Mekies deixou a equipe baseada em Faença para ingressar na Federação Internacional de Automobilismo (FIA) em 2014, como diretor de segurança, ficando responsável por todos os assuntos médicos e de segurança da Federação em todos os seus campeonatos. No início de 2017, ele foi nomeado vice-diretor de corrida da Fórmula 1, além de suas funções existentes, trabalhando ao lado de Charlie Whiting.[6] Ele se mudou para a Scuderia Ferrari, em setembro de 2018, como diretor esportivo.[7] Em 2019, quando Mattia Binotto se tornou o chefe de equipe, Mekies também assumiu a função de chefe da área de atletismo e desempenho, além de suas responsabilidades existentes. Em 2020, ele assumiu a função de diretor esportivo e chefe da área de atletismo.[4]
Em 26 de abril de 2023, foi anunciado que Franz Tost deixaria o cargo de chefe de equipe da AlphaTauri (antiga Toro Rosso) no final da temporada de 2023 e, que ele seria substituído na equipe — que foi renomeada para Racing Bulls — por Mekies, que assumiu o cargo em 2024.[8][9] Em 27 de julho de 2023, a Ferrari confirmou a saída de Mekies no início do mês seguinte e anunciou Diego Ioverno como seu novo diretor esportivo.[10][11]
