LAMB1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | LAMB1, CLM, LIS5, Laminin, beta 1, laminin subunit beta 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 150240 MGI: 96743 HomoloGene: 1722 GeneCards: LAMB1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
cobblestone lissencephaly without muscular or ocular involvement[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • extracellular matrix structural constituent • structural molecule activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • integrin binding |
---|
Клітинна компонента | • laminin-8 complex • GO:0005578 Позаклітинна матриця • laminin-2 complex • extracellular region • базальна мембрана • laminin-10 complex • perinuclear region of cytoplasm • laminin-1 complex • екзосома • міжклітинний простір • endoplasmic reticulum lumen • collagen-containing extracellular matrix • laminin complex |
---|
Біологічний процес | • endodermal cell differentiation • positive regulation of epithelial cell proliferation • positive regulation of cell migration • neuronal-glial interaction involved in cerebral cortex radial glia guided migration • extracellular matrix organization • odontogenesis • адгезія клітин • substrate adhesion-dependent cell spreading • neuron projection development • посттрансляційна модифікація • animal organ morphogenesis • гістогенез • cell migration • basement membrane assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 7: 107.92 – 108 Mb | Хр. 12: 31.32 – 31.38 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LAMB1 (англ. Laminin subunit beta 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 786 амінокислот, а молекулярна маса — 198 038[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGLLQLLAFS | | FLALCRARVR | | AQEPEFSYGC | | AEGSCYPATG | | DLLIGRAQKL |
SVTSTCGLHK | | PEPYCIVSHL | | QEDKKCFICN | | SQDPYHETLN | | PDSHLIENVV |
TTFAPNRLKI | | WWQSENGVEN | | VTIQLDLEAE | | FHFTHLIMTF | | KTFRPAAMLI |
ERSSDFGKTW | | GVYRYFAYDC | | EASFPGISTG | | PMKKVDDIIC | | DSRYSDIEPS |
TEGEVIFRAL | | DPAFKIEDPY | | SPRIQNLLKI | | TNLRIKFVKL | | HTLGDNLLDS |
RMEIREKYYY | | AVYDMVVRGN | | CFCYGHASEC | | APVDGFNEEV | | EGMVHGHCMC |
RHNTKGLNCE | | LCMDFYHDLP | | WRPAEGRNSN | | ACKKCNCNEH | | SISCHFDMAV |
YLATGNVSGG | | VCDDCQHNTM | | GRNCEQCKPF | | YYQHPERDIR | | DPNFCERCTC |
DPAGSQNEGI | | CDSYTDFSTG | | LIAGQCRCKL | | NVEGEHCDVC | | KEGFYDLSSE |
DPFGCKSCAC | | NPLGTIPGGN | | PCDSETGHCY | | CKRLVTGQHC | | DQCLPEHWGL |
SNDLDGCRPC | | DCDLGGALNN | | SCFAESGQCS | | CRPHMIGRQC | | NEVEPGYYFA |
TLDHYLYEAE | | EANLGPGVSI | | VERQYIQDRI | | PSWTGAGFVR | | VPEGAYLEFF |
IDNIPYSMEY | | DILIRYEPQL | | PDHWEKAVIT | | VQRPGRIPTS | | SRCGNTIPDD |
DNQVVSLSPG | | SRYVVLPRPV | | CFEKGTNYTV | | RLELPQYTSS | | DSDVESPYTL |
IDSLVLMPYC | | KSLDIFTVGG | | SGDGVVTNSA | | WETFQRYRCL | | ENSRSVVKTP |
MTDVCRNIIF | | SISALLHQTG | | LACECDPQGS | | LSSVCDPNGG | | QCQCRPNVVG |
RTCNRCAPGT | | FGFGPSGCKP | | CECHLQGSVN | | AFCNPVTGQC | | HCFQGVYARQ |
CDRCLPGHWG | | FPSCQPCQCN | | GHADDCDPVT | | GECLNCQDYT | | MGHNCERCLA |
GYYGDPIIGS | | GDHCRPCPCP | | DGPDSGRQFA | | RSCYQDPVTL | | QLACVCDPGY |
IGSRCDDCAS | | GYFGNPSEVG | | GSCQPCQCHN | | NIDTTDPEAC | | DKETGRCLKC |
LYHTEGEHCQ | | FCRFGYYGDA | | LQQDCRKCVC | | NYLGTVQEHC | | NGSDCQCDKA |
TGQCLCLPNV | | IGQNCDRCAP | | NTWQLASGTG | | CDPCNCNAAH | | SFGPSCNEFT |
GQCQCMPGFG | | GRTCSECQEL | | FWGDPDVECR | | ACDCDPRGIE | | TPQCDQSTGQ |
CVCVEGVEGP | | RCDKCTRGYS | | GVFPDCTPCH | | QCFALWDVII | | AELTNRTHRF |
LEKAKALKIS | | GVIGPYRETV | | DSVERKVSEI | | KDILAQSPAA | | EPLKNIGNLF |
EEAEKLIKDV | | TEMMAQVEVK | | LSDTTSQSNS | | TAKELDSLQT | | EAESLDNTVK |
ELAEQLEFIK | | NSDIRGALDS | | ITKYFQMSLE | | AEERVNASTT | | EPNSTVEQSA |
LMRDRVEDVM | | MERESQFKEK | | QEEQARLLDE | | LAGKLQSLDL | | SAAAEMTCGT |
PPGASCSETE | | CGGPNCRTDE | | GERKCGGPGC | | GGLVTVAHNA | | WQKAMDLDQD |
VLSALAEVEQ | | LSKMVSEAKL | | RADEAKQSAE | | DILLKTNATK | | EKMDKSNEEL |
RNLIKQIRNF | | LTQDSADLDS | | IEAVANEVLK | | MEMPSTPQQL | | QNLTEDIRER |
VESLSQVEVI | | LQHSAADIAR | | AEMLLEEAKR | | ASKSATDVKV | | TADMVKEALE |
EAEKAQVAAE | | KAIKQADEDI | | QGTQNLLTSI | | ESETAASEET | | LFNASQRISE |
LERNVEELKR | | KAAQNSGEAE | | YIEKVVYTVK | | QSAEDVKKTL | | DGELDEKYKK |
VENLIAKKTE | | ESADARRKAE | | MLQNEAKTLL | | AQANSKLQLL | | KDLERKYEDN |
QRYLEDKAQE | | LARLEGEVRS | | LLKDISQKVA | | VYSTCL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Vuolteenaho R., Chow L.T., Tryggvason K. (1990). Structure of the human laminin B1 chain gene. J. Biol. Chem. 265: 15611—15616. PMID 1975589
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з LAMB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6486 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P07942 (англ.) . Архів оригіналу за 28 липня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |