CDK5RAP2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CDK5RAP2, C48, Cep215, MCPH3, CDK5 regulatory subunit associated protein 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608201 MGI: 2384875 HomoloGene: 49533 GeneCards: CDK5RAP2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
ревматоїдний артрит[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
Viroporin 3a[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • microtubule binding • tubulin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • calmodulin binding • gamma-tubulin binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • mitotic spindle pole • центросома • комплекс Ґольджі • spindle pole • pericentriolar material • центр організації мікротрубочок • microtubule plus-end • міжклітинні контакти • perinuclear region of cytoplasm • цитоскелет • мікротрубочка • екзосома |
---|
Біологічний процес | • regulation of neuron differentiation • negative regulation of centriole replication • Нейрогенез • negative regulation of neuron differentiation • chromosome segregation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • brain development • G2/M transition of mitotic cell cycle • microtubule bundle formation • regulation of spindle checkpoint • establishment of mitotic spindle orientation • centriole replication • microtubule organizing center organization • microtubule cytoskeleton organization • ciliary basal body-plasma membrane docking • centrosome cycle • regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • positive regulation of microtubule polymerization • regulation of mitotic cell cycle spindle assembly checkpoint |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001011649 NM_001272039 NM_018249 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001011649 NP_001258968 NP_060719 |
| | NP_035869 NP_001300691 NP_666102 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 120.39 – 120.58 Mb | Хр. 4: 70.14 – 70.33 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CDK5RAP2 (англ. CDK5 regulatory subunit associated protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 893 амінокислот, а молекулярна маса — 215 038[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MMDLVLEEDV | | TVPGTLSGCS | | GLVPSVPDDL | | DGINPNAGLG | | NGLLPNVSEE |
TVSPTRARNM | | KDFENQITEL | | KKENFNLKLR | | IYFLEERMQQ | | EFHGPTEHIY |
KTNIELKVEV | | ESLKRELQER | | EQLLIKASKA | | VESLAEAGGS | | EIQRVKEDAR |
KKVQQVEDLL | | TKRILLLEKD | | VTAAQAELEK | | AFAGTETEKA | | LRLRLESKLS |
EMKKMHEGDL | | AMALVLDEKD | | RLIEELKLSL | | KSKEALIQCL | | KEEKSQMACP |
DENVSSGELR | | GLCAAPREEK | | ERETEAAQME | | HQKERNSFEE | | RIQALEEDLR |
EKEREIATEK | | KNSLKRDKAI | | QGLTMALKSK | | EKKVEELNSE | | IEKLSAAFAK |
AREALQKAQT | | QEFQGSEDYE | | TALSGKEALS | | AALRSQNLTK | | STENHRLRRS |
IKKITQELSD | | LQQERERLEK | | DLEEAHREKS | | KGDCTIRDLR | | NEVEKLRNEV |
NEREKAMENR | | YKSLLSESNK | | KLHNQEQVIK | | HLTESTNQKD | | VLLQKFNEKD |
LEVIQQNCYL | | MAAEDLELRS | | EGLITEKCSS | | QQPPGSKTIF | | SKEKKQSSDY |
EELIQVLKKE | | QDIYTHLVKS | | LQESDSINNL | | QAELNKIFAL | | RKQLEQDVLS |
YQNLRKTLEE | | QISEIRRREE | | ESFSLYSDQT | | SYLSICLEEN | | NRFQVEHFSQ |
EELKKKVSDL | | IQLVKELYTD | | NQHLKKTIFD | | LSCMGFQGNG | | FPDRLASTEQ |
TELLASKEDE | | DTIKIGEDDE | | INFLSDQHLQ | | QSNEIMKDLS | | KGGCKNGYLR |
HTESKISDCD | | GAHAPGCLEE | | GAFINLLAPL | | FNEKATLLLE | | SRPDLLKVVR |
ELLLGQLFLT | | EQEVSGEHLD | | GKTEKTPKQK | | GELVHFVQTN | | SFSKPHDELK |
LSCEAQLVKA | | GEVPKVGLKD | | ASVQTVATEG | | DLLRFKHEAT | | REAWEEKPIN |
TALSAEHRPE | | NLHGVPGWQA | | ALLSLPGITN | | REAKKSRLPI | | LIKPSRSLGN |
MYRLPATQEV | | VTQLQSQILE | | LQGELKEFKT | | CNKQLHQKLI | | LAEAVMEGRP |
TPDKTLLNAQ | | PPVGAAYQDS | | PGEQKGIKTT | | SSVWRDKEMD | | SDQQRSYEID |
SEICPPDDLA | | SLPSCKENPE | | DVLSPTSVAT | | YLSSKSQPSA | | KVSVMGTDQS |
ESINTSNETE | | YLKQKIHDLE | | TELEGYQNFI | | FQLQKHSQCS | | EAIITVLCGT |
EGAQDGLSKP | | KNGSDGEEMT | | FSSLHQVRYV | | KHVKILGPLA | | PEMIDSRVLE |
NLKQQLEEQE | | YKLQKEQNLN | | MQLFSEIHNL | | QNKFRDLSPP | | RYDSLVQSQA |
RELSLQRQQI | | KDGHGICVIS | | RQHMNTMIKA | | FEELLQASDV | | DYCVAEGFQE |
QLNQCAELLE | | KLEKLFLNGK | | SVGVEMNTQN | | ELMERIEEDN | | LTYQHLLPES |
PEPSASHALS | | DYETSEKSFF | | SRDQKQDNET | | EKTSVMVNSF | | SQDLLMEHIQ |
EIRTLRKRLE | | ESIKTNEKLR | | KQLERQGSEF | | VQGSTSIFAS | | GSELHSSLTS |
EIHFLRKQNQ | | ALNAMLIKGS | | RDKQKENDKL | | RESLSRKTVS | | LEHLQREYAS |
VKEENERLQK | | EGSEKERHNQ | | QLIQEVRCSG | | QELSRVQEEV | | KLRQQLLSQN |
DKLLQSLRVE | | LKAYEKLDEE | | HRRLREASGE | | GWKGQDPFRD | | LHSLLMEIQA |
LRLQLERSIE | | TSSTLQSRLK | | EQLARGAEKA | | QEGALTLAVQ | | AVSIPEVPLQ |
PDKHDGDKYP | | MESDNSFDLF | | DSSQAVTPKS | | VSETPPLSGN | | DTDSLSCDSG |
SSATSTPCVS | | RLVTGHHLWA | | SKNGRHVLGL | | IEDYEALLKQ | | ISQGQRLLAE |
MDIQTQEAPS | | STSQELGTKG | | PHPAPLSKFV | | SSVSTAKLTL | | EEAYRRLKLL |
WRVSLPEDGQ | | CPLHCEQIGE | | MKAEVTKLHK | | KLFEQEKKLQ | | NTMKLLQLSK |
RQEKVIFDQL | | VVTHKILRKA | | RGNLELRPGG | | AHPGTCSPSR | | PGS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, апараті гольджі.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Ching Y.-P., Qi Z., Wang J.H. (2000). Cloning of three novel neuronal Cdk5 activator binding proteins. Gene. 242: 285—294. PMID 10721722 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00499-0
- Graser S., Stierhof Y.D., Nigg E.A. (2007). Cep68 and Cep215 (Cdk5rap2) are required for centrosome cohesion. J. Cell Sci. 120: 4321—4331. PMID 18042621 DOI:10.1242/jcs.020248
- Fong K.W., Choi Y.K., Rattner J.B., Qi R.Z. (2008). CDK5RAP2 is a pericentriolar protein that functions in centrosomal attachment of the gamma-tubulin ring complex. Mol. Biol. Cell. 19: 115—125. PMID 17959831 DOI:10.1091/mbc.E07-04-0371
- Haren L., Stearns T., Lueders J. (2009). Plk1-dependent recruitment of gamma-tubulin complexes to mitotic centrosomes involves multiple PCM components. PLoS ONE. 4: E5976—E5976. PMID 19543530 DOI:10.1371/journal.pone.0005976
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CDK5RAP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з CDK5 regulatory subunit associated protein 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18672 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96SN8 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |