Regulator G protein signalizacije

Regulator G protein signalnog domena
Struktura aktivnih konformacija Gi alfa 1.[1]
Identifikatori
SimbolRGS
PfamPF00615
InterProIPR000342
SMARTRGS
PROSITEPDOC50132
SCOP1gia
SUPERFAMILY1gia
OPM protein2bcj
Dostupne proteinske strukture:
Pfamstructures
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary

Regulatori G protein signalizacije (ili RGS) su proteinski strukturni domeni koji aktiviraju GTPaze za heterotrimerne G-proteinske alfa-podjedinice.

RGS proteini su multi-funkcionalni, ubrzavajući proteini GTPaza, koji podstiču GTP hidrolizu alfa podjedinicama heterotrimernih G proteina, čime inaktiviraju G protein i brzo prekidaju signalni puteve G protein-spregnutih receptora[2]. Nakon aktivacije GPCR receptora, heterotrimerni G proteini razmenjuju GDP za GTP, odvajaju se od receptora, i disociraju se u slobodnu, aktivnu GTP-vezanu alfa podjedinicu i beta-gama dimer, ova od kojih aktiviraju nizvodne efektore. Respons se okončava nakon GTP hidrolize alfa podjedinice (IPR001019), koja se zatim vezuje sa beta-gama dimerom (IPR001632 IPR001770) i receptorom. RGS proteini primetno umanjuju životni vek GTP-vezanih alfa podjedinica i stabilizuju G protein prelazno stanje.

Primeri

Sledeći ljudski proteini sadrže ovaj domen:

  • ADRBK1, ADRBK2, AXIN1, AXIN2
  • GRK1, GRK4, GRK5, GRK6, GRK7,
  • RGS1, RGS2, RGS3, RGS4, RGS5, RGS6, RGS7, RGS8, RGS9, RGS10, RGS11, RGS12, RGS13, RGS14, RGS16, RGS17, RGS18, RGS19, RGS20, RGS21
  • RK
  • SNX13

Vidi još

Literatura

  1. ^ Coleman DE, Berghuis AM, Lee E, Linder ME, Gilman AG, Sprang SR (1994). „Structures of active conformations of Gi alpha 1 and the mechanism of GTP hydrolysis”. Science. 265 (5177): 1405—12. PMID 8073283. doi:10.1126/science.8073283. 
  2. ^ De Vries L, Farquhar MG, Zheng B, Fischer T, Elenko E (2000). „The regulator of G protein signaling family”. Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. 40: 235—271. PMID 10836135. doi:10.1146/annurev.pharmtox.40.1.235. 

Dodatna literatura

  • Structure of RGS4 bound to AlF4—activated G(i alpha1): stabilization of the transition state for GTP hydrolysis. Tesmer JJ, Berman DM, Gilman AG, Sprang SR; Cell 1997;89:251-261.
  • Tesmer JJ, Berman DM, Gilman AG, Sprang SR (1997). „Structure of RGS4 bound to AlF4--activated G(i alpha1): stabilization of the transition state for GTP hydrolysis”. Cell. 89 (2): 251—61. PMID 9108480. 
  • Dohlman HG, Apaniesk D, Chen Y, Song J, Nusskern D (1995). „Inhibition of G-protein signaling by dominant gain-of-function mutations in Sst2p, a pheromone desensitization factor in Saccharomyces cerevisiae”. Mol. Cell. Biol. 15 (7): 3635—43. PMC 230601 Слободан приступ. PMID 7791771. 
  • Watson N, Linder ME, Druey KM, Kehrl JH, Blumer KJ (1996). „RGS family members: GTPase-activating proteins for heterotrimeric G-protein alpha-subunits”. Nature. 383 (6596): 172—5. PMID 8774882. doi:10.1038/383172a0. 
  • Berman DM, Wilkie TM, Gilman AG (1996). „GAIP and RGS4 are GTPase-activating proteins for the Gi subfamily of G protein alpha subunits”. Cell. 86 (3): 445—52. PMID 8756726. 
  • De Vries L, Mousli M, Wurmser A, Farquhar MG (1995). „GAIP, a protein that specifically interacts with the trimeric G protein G alpha i3, is a member of a protein family with a highly conserved core domain”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92 (25): 11916—20. PMC 40514 Слободан приступ. PMID 8524874. doi:10.1073/pnas.92.25.11916. 
  • Dohlman HG (2009). „RGS proteins: The early days”. Prog Mol Biol Transl Sci. 86: 1—14. PMID 20374711. 

Spoljašnje veze

  • RGS domen[мртва веза]
  • п
  • р
  • у
Aktivirajući protein GTPaze
Monomerni
Himerin (CHN1, CHN2· RasGAP (NF1, IQGAP) · Tuberozno sklerozni protein (TSC1, TSC2)
Heterotrimeni
Regulator G protein signalizacije: RGS1, RGS2, RGS3, RGS4, RGS5, RGS6, RGS7, RGS8, RGS9, RGS10, RGS11, RGS12, RGS13, RGS14, RGS16, RGS17, RGS18, RGS19, RGS20, RGS21
Faktor razmene guanin nukleotida
EIF2B · Son of Sevenless · Ras-GRF1

FGD: FGD1 · FGD2 · FGD3 · FGD4

ALS2 · SIL1 · IQSEC2
Drugi
  • п
  • р
  • у
Klasa A: Rodopsinu slični
Neurotransmiter
Adrenergički
α1 (A, B, D) • α2 (A, B, C) • β1 • β2 • β3
Purinski
Adenozinski (A1, A2A, A2B, A3) • P2Y (1, 2, 4, 5, 6, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14)
Serotoninski
(svi osim 5-HT3) 5-HT1 (A, B, D, E, F) • 5-HT2 (A, B, C) • 5-HT (4, 5A, 6, 7)
Drugi
Acetilholin (M1, M2, M3, M4, M5) • Dopamin (D1, D2, D3, D4, D5) • Histamin (H1, H2, H3, H4) • Melatonin (1A, 1B, 1C) • TAAR (1, 2, 3, 5, 6, 8, 9)
Metaboliti i
signalni molekuli
Eikozanoidni
CysLT (1, 2) • LTB4 (1, 2) • FPRL1 • OXE • Prostaglandin (DP (1, 2), EP (1, 2, 3, 4), FP) • Prostaciklin • Tromboksan
Drugi
Žučna kiselina • Kanabinoidni (CB1, CB2, GPR (18, 55, 119)) • EBI2 • Estrogen • Slobodna masna kiselina (1, 2, 3, 4) • Laktat • Lizofosfatidna kiselina (1, 2, 3, 4, 5, 6) • Lizofosfolipid (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8) • Niacin (1, 2) • Oksoglutarat • PAF • Sfingozin-1-fosfat (1, 2, 3, 4, 5) • Sukcinat
Peptid
Neuropeptidni
B/W (1, 2) • FF (1, 2) • S • Y (1, 2, 4, 5) • Neuromedin (B, U (1, 2)) • Neurotenzin (1, 2)
Drugi
Anafilatoksin (C3a, C5a) • Angiotenzin (1, 2) • Apelin • Bombezin (BRS3, GRPR, NMBR) • Bradikinin (B1, B2) • Hemokin • Holecistokinin (A, B) • Endotelin (A, B) • Formil peptid (1, 2, 3) • FSH • Galanin (1, 2, 3) • GHB receptor • Gonadotropin-oslobađajući hormon (1, 2) • Grelin • Kispeptin • Luteinizirajući hormon/horiogonadotropin • MAS (1, 1L, D, E, F, G, X1, X2, X3, X4) • Melanokortin (1, 2, 3, 4, 5) • MCHR (1, 2) • Motilin • Opioidni (δ, κ, μ, Nociceptin & ζ, ali ne σ) • Oreksin (1, 2) • Oksitocin • Prokineticin (1, 2) • Prolaktin-oslobađajući peptid • Relaksin (1, 2, 3, 4) • Somatostatin (1, 2, 3, 4, 5) • Tahikinin (1, 2, 3) • Tirotropin • Tirotropin-oslobađajući hormon • Urotenzin-II • Vazopresin (1A, 1B, 2)
Razno
Orfan
GPR (1, 3, 4, 6, 12, 15, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 25, 26, 27, 31, 32, 33, 34, 35, 37, 39, 42, 44, 45, 50, 52, 55, 61, 62, 63, 65, 68, 75, 77, 78, 81, 82, 83, 84, 85, 87, 88, 92, 101, 103, 109A, 109B, 119, 120, 132, 135, 137B, 139, 141, 142, 146, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 160, 161, 162, 171, 173, 174, 176, 177, 182, 183)
Drugi
Adrenomedulin • Mirisni • Opsin (3, 4, 5, 1LW, 1MW, 1SW, RGR, RRH) • Proteazom-aktivirani (1, 2, 3, 4) • SREB (1, 2, 3)
Klasa B: Sekretinu slični
Orfan
GPR (56, 64, 97, 98, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 123, 124, 125, 126, 128, 133, 143, 144, 155, 157)
Drugi
Klasa C: Metabotropni
glutamat / feromon
Ukus
TAS1R (1, 2, 3) • TAS2R (1, 3, 4, 5, 8, 9, 10, 12, 13, 14, 16, 19, 20, 30, 31, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 45, 46, 50)
Drugi
Kalcijum-detektujući receptor • GABA B (1, 2) • Glutamatni receptor (Metabotropni glutamat (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8)) • GPRC6A • GPR (156, 158, 179) • RAIG (1, 2, 3, 4) • VNR (1, 2, 3, 5)
Klasa F:
Frizzled / Zaglađeni
Uvojiti
Frizzled (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10)
Zaglađeni