SIP1

SIP1
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

2LEH, 3S6N

Идентификаторы
ПсевдонимыGEMIN2, SIP1, SIP1-delta, Survival of motor neuron protein-interacting protein 1, gem nuclear organelle associated protein 2
Внешние IDOMIM: 602595 MGI: 1913853 HomoloGene: 37827 GeneCards: GEMIN2
Расположение гена (человек)
14-я хромосома человека
Хр.14-я хромосома человека[1]
14-я хромосома человека
Расположение в геноме GEMIN2
Расположение в геноме GEMIN2
Локус14q21.1Начало39,114,285 bp[1]
Конец39,136,973 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
12-я хромосома мыши
Хр.12-я хромосома мыши[2]
12-я хромосома мыши
Расположение в геноме GEMIN2
Расположение в геноме GEMIN2
Локус12|12 C1Начало59,060,179 bp[2]
Конец59,075,256 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • buccal mucosa cell

  • secondary oocyte

  • ventricular zone

  • right testis

  • left testis
Наибольшая экспрессия в
  • otic placode

  • endocardial cushion

  • primitive streak

  • otic vesicle
Дополнительные справочные данные
BioGPS




Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • связывание с белками плазмы
Компонент клетки
  • SMN complex
  • SMN-Sm protein complex
  • цитозоль
  • spliceosomal complex
  • ядрышко
  • внутренний компонент клетки
  • клеточное ядро
  • нуклеоплазма
  • цитоплазма
  • ядерные тельца
  • gemini of coiled bodies
Биологический процесс
  • RNA splicing, via transesterification reactions
  • mRNA processing
  • spliceosomal complex assembly
  • Сплайсинг
  • spliceosomal snRNP assembly
  • import into nucleus
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

8487

66603

Ensembl

ENSG00000092208

ENSMUSG00000060121

UniProt

O14893

Q9CQQ4

RefSeq (мРНК)

NM_001009182
NM_001009183
NM_003616

NM_025656

RefSeq (белок)

NP_001009182
NP_001009183
NP_003607

NP_079932

Локус (UCSC)Chr 14: 39.11 – 39.14 MbChr 12: 59.06 – 59.08 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Белок связанный с белком выживания моторных нейронов 1 (англ. Survival of motor neuron protein-interacting protein 1) — белок, который у людей кодируется геном SIP1[5][6][7].

Взаимодействия

Как было показано белок SIP1 взаимодействует с DDX20[8][9] и SMN1[6][10][11].

См. также

  • Выживание моторных нейронов
  • SMN1

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000092208 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000060121 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Fischer U., Liu Q., Dreyfuss G. The SMN-SIP1 complex has an essential role in spliceosomal snRNP biogenesis (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1997. — October (vol. 90, no. 6). — P. 1023—1029. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80368-2. — PMID 9323130.
  6. ↑ 1 2 Liu Q., Fischer U., Wang F., Dreyfuss G. The spinal muscular atrophy disease gene product, SMN, and its associated protein SIP1 are in a complex with spliceosomal snRNP proteins (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1997. — October (vol. 90, no. 6). — P. 1013—1021. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80367-0. — PMID 9323129.
  7. ↑ Entrez Gene: SIP1 survival of motor neuron protein interacting protein 1  (неопр.).
  8. ↑ Mourelatos, Zissimos; Dostie Josée; Paushkin Sergey; Sharma Anup; Charroux Bernard; Abel Linda; Rappsilber Juri; Mann Matthias; Dreyfuss Gideon. miRNPs: a novel class of ribonucleoproteins containing numerous microRNAs (англ.) // Genes Dev. : journal. — United States, 2002. — March (vol. 16, no. 6). — P. 720—728. — ISSN 0890-9369. — doi:10.1101/gad.974702. — PMID 11914277. — PMC 155365.
  9. ↑ Charroux B Pellizzoni L Perkinson R A Shevchenko A Mann M Dreyfuss G. Gemin3: A Novel Dead Box Protein That Interacts with Smn, the Spinal Muscular Atrophy Gene Product, and Is a Component of Gems (англ.) // J. Cell Biol.[англ.] : journal. — UNITED STATES, 1999. — December (vol. 147, no. 6). — P. 1181—1194. — ISSN 0021-9525. — doi:10.1083/jcb.147.6.1181. — PMID 10601333. — PMC 2168095.
  10. ↑ Carnegie Graeme K Sleeman Judith E Morrice Nick Hastie C James Peggie Mark W Philp Amanda Lamond Angus I Cohen Patricia T W. Protein phosphatase 4 interacts with the Survival of motor neurons complex and enhances the temporal localisation of snRNPs (англ.) // Journal of Cell Science[англ.] : journal. — England: The Company of Biologists[англ.], 2003. — May (vol. 116, no. Pt 10). — P. 1905—1913. — ISSN 0021-9533. — doi:10.1242/jcs.00409. — PMID 12668731.
  11. ↑ Meister, G; Bühler D Laggerbauer B Zobawa M Lottspeich F Fischer U. Characterization of a nuclear 20S complex containing the survival of motor neurons (SMN) protein and a specific subset of spliceosomal Sm proteins (англ.) // Human Molecular Genetics[англ.] : journal. — ENGLAND: Oxford University Press, 2000. — August (vol. 9, no. 13). — P. 1977—1986. — ISSN 0964-6906. — doi:10.1093/hmg/9.13.1977. — PMID 10942426.
Перейти к шаблону «Клеточное ядро»
Ядерная мембрана/
Ядерная ламина
  • Ядерные поры: Нуклеопорины
    • NUP35[англ.]
    • NUP37[англ.]
    • NUP43[англ.]
    • NUP50[англ.]
    • NUP54[англ.]
    • NUP62[англ.]
    • NUP85[англ.]
    • NUP88[англ.]
    • NUP93[англ.]
    • NUP98[англ.]
    • NUP107[англ.]
    • NUP133[англ.]
    • NUP153[англ.]
    • NUP155[англ.]
    • NUP160
    • NUP188[англ.]
    • NUP205[англ.]
    • NUP210[англ.]
    • NUP214[англ.]
  • AAAS
П:
ЯдрышкоИзбранная статья
Прочее
PML-тельцаХорошая статья
SMC-белки
Переходные
ядерные белки