LRRTM1

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LRRTM1
Identifiants
AliasesLRRTM1
IDs externesOMIM: 610867 MGI: 2389173 HomoloGene: 41763 GeneCards: LRRTM1
Position du gène (Homme)
Chromosome 2 humain
Chr.Chromosome 2 humain[1]
Chromosome 2 humain
Localisation génomique pour LRRTM1
Localisation génomique pour LRRTM1
Locus2p12Début80,288,351 bp[1]
Fin80,304,752 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 6 (souris)
Chr.Chromosome 6 (souris)[2]
Chromosome 6 (souris)
Localisation génomique pour LRRTM1
Localisation génomique pour LRRTM1
Locus6|6 C3Début77,219,672 bp[2]
Fin77,234,774 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • lateral nuclear group of thalamus

  • cortex préfrontal

  • noyau accumbens

  • noyau caudé

  • gyrus temporal moyen

  • putamen

  • Brodmann area 9

  • gyrus cingulaire

  • cortex cingulaire antérieur

  • right frontal lobe
Fortement exprimé dans
  • Corps géniculé latéral

  • medial dorsal nucleus

  • medial geniculate nucleus

  • hippocampus proper

  • barrel cortex

  • Subiculum

  • lobe temporal

  • gyrus denté

  • Cortex piriforme

  • noyau accumbens
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
n/a
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • protein kinase inhibitor activity
  • fonction moléculaire
Composant cellulaire
  • integral component of membrane
  • membrane postsynaptique
  • membrane
  • cône de croissance
  • membrane plasmique
  • synapse
  • excitatory synapse
  • surface cellulaire
  • axone
  • jonction cellulaire
  • réticulum endoplasmique
  • milieu extracellulaire
  • matrice extracellulaire
  • glutamatergic synapse
  • GABA-ergic synapse
  • integral component of postsynaptic membrane
  • integral component of postsynaptic specialization membrane
Processus biologique
  • locomotory behavior
  • negative regulation of protein kinase activity
  • cytokine-mediated signaling pathway
  • negative regulation of receptor internalization
  • organisation d'une synapse
  • Comportement exploratoire
  • protein localization to synapse
  • potentialisation à long terme
  • negative regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT
  • positive regulation of synapse assembly
  • processus biologique
  • regulation of postsynaptic density assembly
  • regulation of presynapse assembly
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

347730

74342

Ensembl

ENSG00000162951

ENSMUSG00000060780

UniProt

Q86UE6

Q8K377

RefSeq (mRNA)

NM_178839

NM_028880
NM_001362109

RefSeq (protéine)

NP_849161

NP_083156
NP_001349038

Localisation (UCSC)Chr 2: 80.29 – 80.3 MbChr 6: 77.22 – 77.23 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

LRRTM1 est le nom d'un gène situé sur le chromosome 2 humain.

Il modifierait l'asymétrie du cerveau et augmente la probabilité d'être gaucher[5].

Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000162951 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000060780 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. (en) Francks C, Maegawa S, Laurén J, Abrahams BS, Monaco AP. et al., « LRRTM1 on chromosome 2p12 is a maternally suppressed gene that is associated paternally with handedness and schizophrenia », Mol Psychiatry (en), vol. 12, no 12,‎ , p. 1129-1139, 1057 (PMID 17667961, PMCID PMC2990633, lire en ligne) modifier.
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