APAF1

APAF1
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

1C15, 1CWW, 1CY5, 1Z6T, 2P1H, 2YGS, 3J2T, 3YGS, 4RHW, 3JBT

Identifiants
AliasesAPAF1
IDs externesOMIM: 602233 MGI: 1306796 HomoloGene: 7626 GeneCards: APAF1
Position du gène (Homme)
Chromosome 12 humain
Chr.Chromosome 12 humain[1]
Chromosome 12 humain
Localisation génomique pour APAF1
Localisation génomique pour APAF1
Locus12q23.1Début98,645,290 bp[1]
Fin98,735,433 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 10 (souris)
Chr.Chromosome 10 (souris)[2]
Chromosome 10 (souris)
Localisation génomique pour APAF1
Localisation génomique pour APAF1
Locus10 C2|10 45.47 cMDébut90,989,311 bp[2]
Fin91,082,770 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • monocyte

  • ventricular zone

  • sang

  • cellule de la moelle osseuse

  • éminence ganglionnaire

  • epithelium of colon

  • granulocyte

  • tendon calcanéen

  • os spongieux

  • testicule
Fortement exprimé dans
  • granulocyte

  • derme

  • migratory enteric neural crest cell

  • uretère

  • Jéjunum

  • canal déférent

  • otic vesicle

  • stroma of bone marrow

  • gastrula

  • iléon
Plus de données d'expression de référence
BioGPS




Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • heat shock protein binding
  • ADP binding
  • liaison protéique
  • identical protein binding
  • liaison ATP
  • liaison nucléotide
  • cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process
Composant cellulaire
  • cytoplasme
  • cytosol
  • exosome
  • noyau
  • apoptosome
  • région extracellulaire
  • secretory granule lumen
  • ficolin-1-rich granule lumen
  • complexe macromoléculaire
Processus biologique
  • cellular response to transforming growth factor beta stimulus
  • neuron apoptotic process
  • regulation of apoptotic process
  • différenciation cellulaire
  • response to hypoxia
  • response to nutrient
  • response to G1 DNA damage checkpoint signaling
  • vieillissement
  • positive regulation of apoptotic signaling pathway
  • glial cell apoptotic process
  • neurodéveloppement
  • développent d'un organisme multicellulaire
  • cardiac muscle cell apoptotic process
  • intrinsic apoptotic signaling pathway
  • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress
  • neural tube closure
  • développement cérébral
  • positive regulation of apoptotic process
  • apoptotic signaling pathway
  • forebrain development
  • regulation of apoptotic DNA fragmentation
  • protein homooligomerization
  • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
  • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process by cytochrome c
  • apoptose
  • neutrophil degranulation
  • negative regulation of G0 to G1 transition
  • kidney development
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

317

11783

Ensembl

ENSG00000120868

ENSMUSG00000019979

UniProt

O14727

O88879

RefSeq (mRNA)

NM_001160
NM_013229
NM_181861
NM_181868
NM_181869

NM_001042558
NM_001282947
NM_009684

RefSeq (protéine)

NP_001151
NP_037361
NP_863651
NP_863658
NP_863659

NP_001036023
NP_001269876
NP_033814

Localisation (UCSC)Chr 12: 98.65 – 98.74 MbChr 10: 90.99 – 91.08 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

Apaf-1 (Apoptotic peptidase activating factor 1) est une protéine qui rentre dans la composition de l'apoptosome et joue un rôle dans la voie de signalisation intrinsèque déclenchant l'apoptose.

Apaf-1 est présent dans le cytosol à l'état normal de la cellule, mais il est sous une conformation repliée inactive. La liaison du cytochrome c (CYC) à l'Apaf-1 entraîne une modification conformationnelle et l'exposition du domaine CARD, qui permet à plusieurs protéines Apaf-1 activées de s'assembler : c'est l'apoptosome.

Structure

Apaf-1 possède 3 domaines notables[5].

  • un domaine CARD (en) N-terminal permettant le recrutement de caspases (en particulier la caspase 9)
  • un domaine NOD permettant la polymérisation (fixation avec d'autres apaf-1)
  • un domaine WRD C-terminal permettant la fixation du cytochrome c.

Références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000120868 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000019979 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. (en) Shawn B. Bratton et Guy S. Salvesen, « Regulation of the Apaf-1–caspase-9 apoptosome », J Cell Sci, vol. 123,‎ , p. 3209-14 (lire en ligne)
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