維甲酸誘導基因-I

DDX58
已知的結構
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PDBID列表

2LWD、​2LWE、​2QFB、​2QFD、​2RMJ、​2YKG、​3LRN、​3LRR、​3NCU、​3OG8、​3ZD6、​3ZD7、​4AY2、​4BPB、​4NQK、​4ON9、​4P4H、​5E3H、​5F98、​5F9F、​5F9H

識別號
别名DDX58；, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 58, RIGI, RLR-1, SGMRT2, RIG-I, DEXD/H-box helicase 58, RIG1
外部IDOMIM：609631 MGI：2442858 HomoloGene：32215 GeneCards：DDX58
基因位置（人类）
9號染色體
染色体9號染色體[1]
9號染色體
DDX58的基因位置
DDX58的基因位置
基因座9p21.1起始32,455,302 bp[1]
终止32,526,208 bp[1]
基因位置（小鼠）
小鼠4号染色体
染色体小鼠4号染色体[2]
小鼠4号染色体
DDX58的基因位置
DDX58的基因位置
基因座4|4 A5起始40,203,773 bp[2]
终止40,239,828 bp[2]
RNA表达模式
查阅更多表达数据
基因本體
分子功能• 核苷酸結合
• helicase activity
• 鋅離子結合
• 金屬離子結合
• 血浆蛋白结合
• single-stranded RNA binding
• 相同蛋白质结合
• RNA binding
• double-stranded RNA binding
• double-stranded DNA binding
• 水解酶活性
• ATP結合
• nucleic acid binding
• 泛素蛋白连接酶结合
細胞組分• 細胞質
• cell projection
• 膜
• 双细胞紧密连接
• 细胞膜
• ruffle membrane
• 细胞连接
• actin cytoskeleton
• 细胞骨架
• 细胞质基质
生物學過程• regulation of cell migration
• response to exogenous dsRNA
• positive regulation of interferon-alpha production
• immune system process
• response to virus
• cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway in response to virus
• positive regulation of gene expression
• positive regulation of granulocyte macrophage colony-stimulating factor production
• positive regulation of interleukin-8 production
• positive regulation of interleukin-6 production
• negative regulation of type I interferon production
• detection of virus
• viral process
• 先天免疫系統
• positive regulation of transcription by RNA polymerase II
• RIG-I signaling pathway
• regulation of type III interferon production
• positive regulation of defense response to virus by host
• positive regulation of interferon-beta production
• protein deubiquitination
• positive regulation of response to cytokine stimulus
• cellular response to exogenous dsRNA
• defense response to virus
• positive regulation of DNA-binding transcription factor activity
• positive regulation of myeloid dendritic cell cytokine production
Sources:Amigo / QuickGO
直系同源
物種人類小鼠
Entrez

23586

230073

Ensembl

ENSG00000107201

ENSMUSG00000040296

UniProt

O95786

Q6Q899

mRNA​序列

NM_014314

NM_172689

蛋白序列

NP_055129

NP_766277

基因位置​（UCSC）Chr 9: 32.46 – 32.53 MbChr 4: 40.2 – 40.24 Mb
PubMed​查找[3][4]
維基數據
檢視/編輯人類檢視/編輯小鼠

维甲酸诱导基因-I[5]（RIG-I，retinoic acid-inducible gene I）是脊椎動物細胞質中的一種模式识别受体（PRR），結構上屬於DExD/H-box（英语：DExD/H box proteins）类RNA解旋酶[6][7][8]，在人類基因組中由DDX58基因編碼[9]，其N端有兩個CARD結構域（英语：CARD domain），C端則可與RNA結合，為先天免疫反應中的重要蛋白[6][7]。

RIG-I平時處於不活化狀態，在細胞被西尼羅河病毒、黃熱病毒（英语：Flavivirus）、日本腦炎病毒、A型流感病毒、仙台病毒與冠狀病毒等RNA病毒感染後[6][10]，RIG-I可與病毒的雙股RNA（dsRNA）結合而被活化，接著即可以CARD結構域和粒線體外膜上的线粒体抗病毒信号蛋白（英语：Mitochondrial antiviral-signaling protein）（MAVS）結合[7]，啟動第一型干擾素（英语：Interferon type I）（IFN I）途徑的免疫反應[6]，後者可阻止病毒擴散、造成發炎反應以及協助活化後天免疫[11]。除識別病毒RNA外，在不同癌細胞中RIG-I還能啟動其他反應，包括促進或抑制腫瘤增殖（因腫瘤類型而異）、活化B細胞、影響細胞分化等[12]。有些無脊椎動物（牡蠣）也具有和RIG-I與MAVS同源的蛋白，且可能也有抗病毒的免疫功能[13]

不活化與活化的RIG-I結構示意圖

參考文獻

  1. ^ 1.0 1.1 1.2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000107201 - Ensembl, May 2017
  2. ^ 2.0 2.1 2.2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000040296 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  4. ^ Mouse PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  5. ^ 存档副本. [2021-07-06]. （原始内容存档于2021-07-09）. 
  6. ^ 6.0 6.1 6.2 6.3 Kell AM, Gale M. RIG-I in RNA virus recognition. Virology. May 2015,. 479-480: 110–21. PMC 4424084 可免费查阅. PMID 25749629. doi:10.1016/j.virol.2015.02.017. 
  7. ^ 7.0 7.1 7.2 Brisse M, Ly H. Comparative Structure and Function Analysis of the RIG-I-Like Receptors: RIG-I and MDA5. Frontiers in Immunology. 2019, 10: 1586. PMC 6652118 可免费查阅. PMID 31379819. doi:10.3389/fimmu.2019.01586 （英语）. 
  8. ^ Xu XX, Wan H, Nie L, Shao T, Xiang LX, Shao JZ. RIG-I: a multifunctional protein beyond a pattern recognition receptor. Protein & Cell. March 2018, 9 (3): 246–253. PMC 5829270 可免费查阅. PMID 28593618. doi:10.1007/s13238-017-0431-5. 
  9. ^ DDX58 DExD/H-box helicase 58 [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI. www.ncbi.nlm.nih.gov. [2020-02-29]. （原始内容存档于2021-04-24）. 
  10. ^ Solis M, Nakhaei P, Jalalirad M, Lacoste J, Douville R, Arguello M, et al. RIG-I-mediated antiviral signaling is inhibited in HIV-1 infection by a protease-mediated sequestration of RIG-I. Journal of Virology. February 2011, 85 (3): 1224–36. PMC 3020501 可免费查阅. PMID 21084468. doi:10.1128/JVI.01635-10. 
  11. ^ Ivashkiv LB, Donlin LT. Regulation of type I interferon responses. Nature Reviews. Immunology. January 2014, 14 (1): 36–49. PMC 4084561 可免费查阅. PMID 24362405. doi:10.1038/nri3581. 
  12. ^ Xu XX, Wan H, Nie L, Shao T, Xiang LX, Shao JZ. RIG-I: a multifunctional protein beyond a pattern recognition receptor.. Protein Cell. 2018, 9 (3): 246–253. PMC 5829270 可免费查阅. PMID 28593618. doi:10.1007/s13238-017-0431-5. 
  13. ^ Huang B, Zhang L, Du Y, Xu F, Li L, Zhang G. Characterization of the Mollusc RIG-I/MAVS Pathway Reveals an Archaic Antiviral Signalling Framework in Invertebrates.. Sci Rep. 2017, 7 (1): 8217. PMC 5557890 可免费查阅. PMID 28811654. doi:10.1038/s41598-017-08566-x. 
  • 分子與細胞生物學主题