YBX2 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

YBX2

Ідентифікатори

Символи

YBX2, CONTRIN, CSDA3, DBPC, MSY2, Y-box binding protein 2

Зовнішні ІД

OMIM: 611447 MGI: 1096372 HomoloGene: 22942 GeneCards: YBX2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • RNA binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинне ядро • fibrillar center
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • translational attenuation • transcription by RNA polymerase II • Сперматогенез • oocyte development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of cold-induced thermogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


51087


53422

Ensembl


ENSG00000006047 ENSG00000288504


ENSMUSG00000018554

UniProt


Q9Y2T7


Q9Z2C8

RefSeq (мРНК)


NM_015982


NM_016875 NM_001347634

RefSeq (білок)


NP_057066


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 17: 7.29 – 7.29 Mb

Хр. 11: 69.94 – 69.94 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

YBX2 (англ. Y-box binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 364 амінокислот, а молекулярна маса — 38 518^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSEVEAAAGA	TAVPAATVPA	TAAGVVAVVV	PVPAGEPQKG	GGAGGGGGAA
SGPAAGTPSA	PGSRTPGNPA	TAVSGTPAPP	ARSQADKPVL	AIQVLGTVKW
FNVRNGYGFI	NRNDTKEDVF	VHQTAIKRNN	PRKFLRSVGD	GETVEFDVVE
GEKGAEATNV	TGPGGVPVKG	SRYAPNRRKS	RRFIPRPPSV	APPPMVAEIP
SAGTGPGSKG	ERAEDSGQRP	RRWCPPPFFY	RRRFVRGPRP	PNQQQPIEGT
DRVEPKETAP	LEGHQQQGDE	RVPPPRFRPR	YRRPFRPRPR	QQPTTEGGDG
ETKPSQGPAD	GSRPEPQRPR	NRPYFQRRRQ	QAPGPQQAPG	PRQPAAPETS
APVNSGDPTT	TILE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tekur S., Pawlak A., Guellaen G., Hecht N.B. (1999). Contrin, the human homologue of a germ-cell Y-box-binding protein: cloning, expression, and chromosomal localization. J. Androl. 20: 135—144. PMID 10100484

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17948 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y2T7 (англ.) . Архів оригіналу за 4 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.