VTCN1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

VTCN1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4GOS

Ідентифікатори

Символи

VTCN1, B7-H4, B7H4, B7S1, B7X, B7h.5, PRO1291, VCTN1, V-set domain containing T cell activation inhibitor 1, V-set domain containing T-cell activation inhibitor 1

Зовнішні ІД

OMIM: 608162 MGI: 3039619 HomoloGene: 11627 GeneCards: VTCN1

Пов'язані генетичні захворювання

ювенільний ревматоїдний артрит^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• signaling receptor binding • молекулярна функція
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • external side of plasma membrane
Біологічний процес	• адаптивна імунна відповідь • positive regulation of T cell proliferation • response to protozoan • процес імунної системи • negative regulation of T cell proliferation • negative regulation of apoptotic process • negative regulation of T cell activation • regulation of immune response • T cell receptor signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


79679


242122

Ensembl


ENSG00000134258


ENSMUSG00000051076

UniProt


Q7Z7D3


Q7TSP5

RefSeq (мРНК)


NM_001253849 NM_001253850 NM_024626


NM_178594

RefSeq (білок)


NP_001240778 NP_001240779 NP_078902


NP_848709

Локус (UCSC)

Хр. 1: 117.14 – 117.21 Mb

Хр. 3: 100.73 – 100.8 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

VTCN1 (англ. V-set domain containing T-cell activation inhibitor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 282 амінокислот, а молекулярна маса — 30 878^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASLGQILFW	SIISIIIILA	GAIALIIGFG	ISGRHSITVT	TVASAGNIGE
DGILSCTFEP	DIKLSDIVIQ	WLKEGVLGLV	HEFKEGKDEL	SEQDEMFRGR
TAVFADQVIV	GNASLRLKNV	QLTDAGTYKC	YIITSKGKGN	ANLEYKTGAF
SMPEVNVDYN	ASSETLRCEA	PRWFPQPTVV	WASQVDQGAN	FSEVSNTSFE
LNSENVTMKV	VSVLYNVTIN	NTYSCMIEND	IAKATGDIKV	TESEIKRRSH
LQLLNSKASL	CVSSFFAISW	ALLPLSPYLM	LK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як адаптивний імунітет, імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з VTCN1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28873 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q7Z7D3 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.