TIMP3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3CKI

Ідентифікатори

Символи

TIMP3, HSMRK222, K222, K222TA2, SFD, TIMP metallopeptidase inhibitor 3

Зовнішні ІД

OMIM: 188826 MGI: 98754 HomoloGene: 36322 GeneCards: TIMP3

Пов'язані генетичні захворювання

Sorsby's fundus dystrophy^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptidase inhibitor activity • GO:0048551 enzyme inhibitor activity • зв'язування з іоном металу • protease binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • metalloendopeptidase inhibitor activity
Клітинна компонента	• GO:0005578 Позаклітинна матриця • базальна мембрана • екзосома • клітинне ядро • extracellular region • platelet dense granule lumen • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix
Біологічний процес	• cellular response to organic substance • negative regulation of peptidase activity • відповідь на стимул • positive regulation of TRAIL-activated apoptotic signaling pathway • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade • negative regulation of membrane protein ectodomain proteolysis • зір • platelet degranulation • response to organic substance • negative regulation of metalloendopeptidase activity • response to hormone • negative regulation of endopeptidase activity • response to cytokine
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7078


21859

Ensembl


ENSG00000100234


ENSMUSG00000020044

UniProt


P35625


P39876

RefSeq (мРНК)


NM_000362


NM_011595

RefSeq (білок)


NP_000353


NP_035725

Локус (UCSC)

Хр. 22: 32.8 – 32.86 Mb

Хр. 10: 86.14 – 86.19 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TIMP3 (англ. TIMP metallopeptidase inhibitor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 211 амінокислот, а молекулярна маса — 24 145^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTPWLGLIVL	LGSWSLGDWG	AEACTCSPSH	PQDAFCNSDI	VIRAKVVGKK
LVKEGPFGTL	VYTIKQMKMY	RGFTKMPHVQ	YIHTEASESL	CGLKLEVNKY
QYLLTGRVYD	GKMYTGLCNF	VERWDQLTLS	QRKGLNYRYH	LGCNCKIKSC
YYLPCFVTSK	NECLWTDMLS	NFGYPGYQSK	HYACIRQKGG	YCSWYRGWAP
PDKSIINATD	P

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібіторів металоферментів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

Silbiger S.M., Jacobsen V.L., Cupples R.L., Koski R.A. (1994). Cloning of cDNAs encoding human TIMP-3, a novel member of the tissue inhibitor of metalloproteinase family. Gene. 141: 293—297. PMID 8163205 DOI:10.1016/0378-1119(94)90588-6
Stoehr H., Roomp K., Felbor U., Weber B.H.F. (1995). Genomic organization of the human tissue inhibitor of metalloproteinases-3 (TIMP3). Genome Res. 5: 483—487. PMID 8808469 DOI:10.1101/gr.5.5.483
Ruiz A.C., Brett P., Bok D. (1996). TIMP-3 is expressed in the human retinal pigment epithelium. Biochem. Biophys. Res. Commun. 226: 467—474. PMID 8806658 DOI:10.1006/bbrc.1996.1379
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Apte S.S., Mattei M.-G., Olsen B.R. (1994). Cloning of the cDNA encoding human tissue inhibitor of metalloproteinases-3 (TIMP-3) and mapping of the TIMP3 gene to chromosome 22. Genomics. 19: 86—90. PMID 8188246 DOI:10.1006/geno.1994.1016
Kishnani N.S., Staskus P.W., Yang T.-T., Masiarz F.R., Hawkes S.P. (1995). Identification and characterization of human tissue inhibitor of metalloproteinase-3 and detection of three additional metalloproteinase inhibitor activities in extracellular matrix. Matrix Biol. 14: 479—488. PMID 7795886 DOI:10.1016/0945-053X(95)90005-5

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TIMP3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11822 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P35625 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.