STX5

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3EFO

Ідентифікатори

Символи

STX5, SED5, STX5A, syntaxin 5

Зовнішні ІД

OMIM: 603189 MGI: 1928483 HomoloGene: 2381 GeneCards: STX5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein N-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • SNARE binding • SNAP receptor activity • cadherin binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • везикула • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • ER to Golgi transport vesicle membrane • SNARE complex • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane • комплекс Ґольджі • гіалоплазма • Golgi membrane • система ендомембран
Біологічний процес	• GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • vesicle fusion with Golgi apparatus • early endosome to Golgi transport • vesicle docking • COPII vesicle coating • regulation of Golgi organization • retrograde transport, endosome to Golgi • Golgi disassembly • vesicle fusion • vesicle-mediated transport • intracellular protein transport • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6811


56389

Ensembl


ENSG00000162236


ENSMUSG00000010110

UniProt


Q13190


Q8K1E0

RefSeq (мРНК)


NM_001244666 NM_003164 NM_001330294


NM_001167799 NM_019829

RefSeq (білок)


NP_001231595 NP_001317223 NP_003155


NP_001161271 NP_062803

Локус (UCSC)

Хр. 11: 62.81 – 62.83 Mb

Хр. 19: 8.72 – 8.73 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

STX5 (англ. Syntaxin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 355 амінокислот, а молекулярна маса — 39 673^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MIPRKRYGSK	NTDQGVYLGL	SKTQVLSPAT	AGSSSSDIAP	LPPPVTLVPP
PPDTMSCRDR	TQEFLSACKS	LQTRQNGIQT	NKPALRAVRQ	RSEFTLMAKR
IGKDLSNTFA	KLEKLTILAK	RKSLFDDKAV	EIEELTYIIK	QDINSLNKQI
AQLQDFVRAK	GSQSGRHLQT	HSNTIVVSLQ	SKLASMSNDF	KSVLEVRTEN
LKQQRSRREQ	FSRAPVSALP	LAPNHLGGGA	VVLGAESHAS	KDVAIDMMDS
RTSQQLQLID	EQDSYIQSRA	DTMQNIESTI	VELGSIFQQL	AHMVKEQEET
IQRIDENVLG	AQLDVEAAHS	EILKYFQSVT	SNRWLMVKIF	LILIVFFIIF
VVFLA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.

Література

Ravichandran V., Roche P.A. (1997). Cloning and identification of human syntaxin 5 as a synaptobrevin/VAMP binding protein. J. Mol. Neurosci. 8: 159—161. PMID 9188044 DOI:10.1007/BF02736780
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Laufman O., Kedan A., Hong W., Lev S. (2009). Direct interaction between the COG complex and the SM protein, Sly1, is required for Golgi SNARE pairing. EMBO J. 28: 2006—2017. PMID 19536132 DOI:10.1038/emboj.2009.168
Mancias J.D., Goldberg J. (2008). Structural basis of cargo membrane protein discrimination by the human COPII coat machinery. EMBO J. 27: 2918—2928. PMID 18843296 DOI:10.1038/emboj.2008.208

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11440 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q13190 (англ.) . Архів оригіналу за 4 грудня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.