SLX4 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4M7C, 4UYI, 4ZOU | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SLX4, BTBD12, FANCP, MUS312, SLX4 structure-specific endonuclease subunit |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 613278 MGI: 106299 HomoloGene: 23770 GeneCards: SLX4 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Fanconi anemia complementation group P[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0010577 enzyme activator activity • endodeoxyribonuclease activity • crossover junction endodeoxyribonuclease activity • 5'-flap endonuclease activity • 3'-flap endonuclease activity |
---|
Клітинна компонента | • ERCC4-ERCC1 complex • нуклеоплазма • міжклітинні контакти • Holliday junction resolvase complex • клітинне ядро • теломера • гіалоплазма • Slx1-Slx4 complex |
---|
Біологічний процес | • nucleotide-excision repair • DNA recombination • positive regulation of t-circle formation • cellular response to DNA damage stimulus • DNA double-strand break processing involved in repair via single-strand annealing • реплікація ДНК • response to intra-S DNA damage checkpoint signaling • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity • GO:0100026 Репарація ДНК • interstrand cross-link repair • resolution of meiotic recombination intermediates • double-strand break repair via homologous recombination • meiotic DNA double-strand break processing • telomeric D-loop disassembly • t-circle formation • negative regulation of telomere maintenance via telomere lengthening |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | NP_803423 NP_001389852 NP_001389853 NP_001389854 NP_001389855
| NP_001389856 NP_001389857 NP_001389859 NP_001389860 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 3.58 – 3.61 Mb | Хр. 16: 3.98 – 4 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SLX4 (англ. SLX4 structure-specific endonuclease subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 834 амінокислот, а молекулярна маса — 200 012[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MKLSVNEAQL | | GFYLGSLSHL | | SACPGIDPRS | | SEDQPESLKT | | GQMMDESDED |
FKELCASFFQ | | RVKKHGIKEV | | SGERKTQKAA | | SNGTQIRSKL | | KRTKQTATKT |
KTLQGPAEKK | | PPSGSQAPRT | | KKQRVTKWQA | | SEPAHSVNGE | | GGVLASAPDP |
PVLRETAQNT | | QTGNQQEPSP | | NLSREKTREN | | VPNSDSQPPP | | SCLTTAVPSP |
SKPRTAQLVL | | QRMQQFKRAD | | PERLRHASEE | | CSLEAAREEN | | VPKDPQEEMM |
AGNVYGLGPP | | APESDAAVAL | | TLQQEFARVG | | ASAHDDSLEE | | KGLFFCQICQ |
KNLSAMNVTR | | REQHVNRCLD | | EAEKTLRPSV | | PQIPECPICG | | KPFLTLKSRT |
SHLKQCAVKM | | EVGPQLLLQA | | VRLQTAQPEG | | SSSPPMFSFS | | DHSRGLKRRG |
PTSKKEPRKR | | RKVDEAPSED | | LLVAMALSRS | | EMEPGAAVPA | | LRLESAFSER |
IRPEAENKSR | | KKKPPVSPPL | | LLVQDSETTG | | RQIEDRVALL | | LSEEVELSST |
PPLPASRILK | | EGWERAGQCP | | PPPERKQSFL | | WEGSALTGAW | | AMEDFYTARL |
VPPLVPQRPA | | QGLMQEPVPP | | LVPPEHSELS | | ERRSPALHGT | | PTAGCGSRGP |
SPSASQREHQ | | ALQDLVDLAR | | EGLSASPWPG | | SGGLAGSEGT | | AGLDVVPGGL |
PLTGFVVPSQ | | DKHPDRGGRT | | LLSLGLLVAD | | FGAMVNNPHL | | SDVQFQTDSG |
EVLYAHKFVL | | YARCPLLIQY | | VNNEGFSAVE | | DGVLTQRVLL | | GDVSTEAART |
FLHYLYTADT | | GLPPGLSSEL | | SSLAHRFGVS | | ELVHLCEQVP | | IATDSEGKPW |
EEKEAENCES | | RAENFQELLR | | SMWADEEEEA | | ETLLKSKDHE | | EDQENVNEAE |
MEEIYEFAAT | | QRKLLQEERA | | AGAGEDADWL | | EGGSPVSGQL | | LAGVQVQKQW |
DKVEEMEPLE | | PGRDEAATTW | | EKMGQCALPP | | PQGQHSGARG | | AEAPEQEAPE |
EALGHSSCSS | | PSRDCQAERK | | EGSLPHSDDA | | GDYEQLFSST | | QGEISEPSQI |
TSEPEEQSGA | | VRERGLEVSH | | RLAPWQASPP | | HPCRFLLGPP | | QGGSPRGSHH |
TSGSSLSTPR | | SRGGTSQVGS | | PTLLSPAVPS | | KQKRDRSILT | | LSKEPGHQKG |
KERRSVLECR | | NKGVLMFPEK | | SPSIDLTQSN | | PDHSSSRSQK | | SSSKLNEEDE |
VILLLDSDEE | | LELEQTKMKS | | ISSDPLEEKK | | ALEISPRSCE | | LFSIIDVDAD |
QEPSQSPPRS | | EAVLQQEDEG | | ALPENRGSLG | | RRGAPWLFCD | | RESSPSEAST |
TDTSWLVPAT | | PLASRSRDCS | | SQTQISSLRS | | GLAVQAVTQH | | TPRASVGNRE |
GNEVAQKFSV | | IRPQTPPPQT | | PSSCLTPVSP | | GTSDGRRQGH | | RSPSRPHPGG |
HPHSSPLAPH | | PISGDRAHFS | | RRFLKHSPPG | | PSFLNQTPAG | | EVVEVGDSDD |
EQEVASHQAN | | RSPPLDSDPP | | IPIDDCCWHM | | EPLSPIPIDH | | WNLERTGPLS |
TSSPSRRMNE | | AADSRDCRSP | | GLLDTTPIRG | | SCTTQRKLQE | | KSSGAGSLGN |
SRPSFLNSAL | | WDVWDGEEQR | | PPETPPPAQM | | PSAGGAQKPE | | GLETPKGANR |
KKNLPPKVPI | | TPMPQYSIME | | TPVLKKELDR | | FGVRPLPKRQ | | MVLKLKEIFQ |
YTHQTLDSDS | | EDESQSSQPL | | LQAPHCQTLA | | SQTYKPSRAG | | VHAQQEATTG |
PGAHRPKGPA | | KTKGPRHQRK | | HHESITPPSR | | SPTKEAPPGL | | NDDAQIPASQ |
ESVATSVDGS | | DSSLSSQSSS | | SCEFGAAFES | | AGEEEGEGEV | | SASQAAVQAA |
DTDEALRCYI | | RSKPALYQKV | | LLYQPFELRE | | LQAELRQNGL | | RVSSRRLLDF |
LDTHCITFTT | | AATRREKLQG | | RRRQPRGKKK | | VERN |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXII. The complete sequences of 50 new cDNA clones which code for large proteins. DNA Res. 8: 319—327. PMID 11853319 DOI:10.1093/dnares/8.6.319
- Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SLX4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23845 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q8IY92 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |