PTBP1
PTBP1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PTBP1, HNRNP-I, HNRNPI, HNRPI, PTB, PTB-1, PTB-T, PTB2, PTB3, PTB4, pPTB, polypyrimidine tract binding protein 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 600693 MGI: 97791 HomoloGene: 49188 GeneCards: PTBP1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
![]() ![]() ![]() | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 19: 0.8 – 0.81 Mb | Хр. 10: 79.69 – 79.7 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
PTBP1 (англ. Polypyrimidine tract binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 531 амінокислот, а молекулярна маса — 57 221[4].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MDGIVPDIAV | GTKRGSDELF | STCVTNGPFI | MSSNSASAAN | GNDSKKFKGD | ||||
SRSAGVPSRV | IHIRKLPIDV | TEGEVISLGL | PFGKVTNLLM | LKGKNQAFIE | ||||
MNTEEAANTM | VNYYTSVTPV | LRGQPIYIQF | SNHKELKTDS | SPNQARAQAA | ||||
LQAVNSVQSG | NLALAASAAA | VDAGMAMAGQ | SPVLRIIVEN | LFYPVTLDVL | ||||
HQIFSKFGTV | LKIITFTKNN | QFQALLQYAD | PVSAQHAKLS | LDGQNIYNAC | ||||
CTLRIDFSKL | TSLNVKYNND | KSRDYTRPDL | PSGDSQPSLD | QTMAAAFGLS | ||||
VPNVHGALAP | LAIPSAAAAA | AAAGRIAIPG | LAGAGNSVLL | VSNLNPERVT | ||||
PQSLFILFGV | YGDVQRVKIL | FNKKENALVQ | MADGNQAQLA | MSHLNGHKLH | ||||
GKPIRITLSK | HQNVQLPREG | QEDQGLTKDY | GNSPLHRFKK | PGSKNFQNIF | ||||
PPSATLHLSN | IPPSVSEEDL | KVLFSSNGGV | VKGFKFFQKD | RKMALIQMGS | ||||
VEEAVQALID | LHNHDLGENH | HLRVSFSKST | I |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Gil A., Sharp P.A., Jamison S.F., Garcia-Blanco M.A. (1991). Characterization of cDNAs encoding the polypyrimidine tract-binding protein. Genes Dev. 5: 1224—1236. PMID 1906035 DOI:10.1101/gad.5.7.1224
- Patton J.G., Mayer S.A., Tempst P., Nadal-Ginard B. (1991). Characterization and molecular cloning of polypyrimidine tract-binding protein: a component of a complex necessary for pre-mRNA splicing. Genes Dev. 5: 1237—1251. PMID 1906036 DOI:10.1101/gad.5.7.1237
- Ghetti A., Pinol-Roma S., Michael W., Morandi C., Dreyfuss G. (1992). hnRNP I, the polypyrimidine tract-binding protein: distinct nuclear localization and association with hnRNAs. Nucleic Acids Res. 20: 3671—3678. PMID 1641332 DOI:10.1093/nar/20.14.3671
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lin J.C., Tarn W.Y. (2005). Exon selection in alpha-tropomyosin mRNA is regulated by the antagonistic action of RBM4 and PTB. Mol. Cell. Biol. 25: 10111—10121. PMID 16260624 DOI:10.1128/MCB.25.22.10111-10121.2005
- Lin J.C., Tarn W.Y. (2011). RBM4 down-regulates PTB and antagonizes its activity in muscle cell-specific alternative splicing. J. Cell Biol. 193: 509—520. PMID 21518792 DOI:10.1083/jcb.201007131
Примітки
Див. також
- Хромосома 19
![]() | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
|