PRPF3 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/8d/Protein_PRPF3_PDB_1x4q.png/250px-Protein_PRPF3_PDB_1x4q.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1X4Q, 3JCR | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PRPF3, pre-mRNA processing factor 3, HPRP3, HPRP3P, PRP3, Prp3p, RP18, SNRNP90 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607301 MGI: 1918017 HomoloGene: 3447 GeneCards: PRPF3 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
retinitis pigmentosa 18[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • Тільце Кахаля • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • nuclear speck • GO:0009327 protein-containing complex • U2-type precatalytic spliceosome |
---|
Біологічний процес | • RNA splicing, via transesterification reactions • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • spliceosomal tri-snRNP complex assembly • Сплайсинг РНК |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b5/PBB_GE_PRPF3_202251_at_fs.png/250px-PBB_GE_PRPF3_202251_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 150.32 – 150.35 Mb | Хр. 3: 95.74 – 95.76 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PRPF3 (англ. Pre-mRNA processing factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 683 амінокислот, а молекулярна маса — 77 529[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MALSKRELDE | | LKPWIEKTVK | | RVLGFSEPTV | | VTAALNCVGK | | GMDKKKAADH |
LKPFLDDSTL | | RFVDKLFEAV | | EEGRSSRHSK | | SSSDRSRKRE | | LKEVFGDDSE |
ISKESSGVKK | | RRIPRFEEVE | | EEPEVIPGPP | | SESPGMLTKL | | QIKQMMEAAT |
RQIEERKKQL | | SFISPPTPQP | | KTPSSSQPER | | LPIGNTIQPS | | QAATFMNDAI |
EKARKAAELQ | | ARIQAQLALK | | PGLIGNANMV | | GLANLHAMGI | | APPKVELKDQ |
TKPTPLILDE | | QGRTVDATGK | | EIELTHRMPT | | LKANIRAVKR | | EQFKQQLKEK |
PSEDMESNTF | | FDPRVSIAPS | | QRQRRTFKFH | | DKGKFEKIAQ | | RLRTKAQLEK |
LQAEISQAAR | | KTGIHTSTRL | | ALIAPKKELK | | EGDIPEIEWW | | DSYIIPNGFD |
LTEENPKRED | | YFGITNLVEH | | PAQLNPPVDN | | DTPVTLGVYL | | TKKEQKKLRR |
QTRREAQKEL | | QEKVRLGLMP | | PPEPKVRISN | | LMRVLGTEAV | | QDPTKVEAHV |
RAQMAKRQKA | | HEEANAARKL | | TAEQRKVKKI | | KKLKEDISQG | | VHISVYRVRN |
LSNPAKKFKI | | EANAGQLYLT | | GVVVLHKDVN | | VVVVEGGPKA | | QKKFKRLMLH |
RIKWDEQTSN | | TKGDDDEESD | | EEAVKKTNKC | | VLVWEGTAKD | | RSFGEMKFKQ |
CPTENMAREH | | FKKHGAEHYW | | DLALSESVLE | | STD |
Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Medenbach J., Schreiner S., Liu S., Luhrmann R., Bindereif A. (2004). Human U4/U6 snRNP recycling factor p110: mutational analysis reveals the function of the tetratricopeptide repeat domain in recycling. Mol. Cell. Biol. 24: 7392—7401. PMID 15314151 DOI:10.1128/MCB.24.17.7392-7401.2004
- Liu S., Rauhut R., Vornlocher H.-P., Luehrmann R. (2006). The network of protein-protein interactions within the human U4/U6.U5 tri-snRNP. RNA. 12: 1418—1430. PMID 16723661 DOI:10.1261/rna.55406
- Gonzalez-Santos J.M., Cao H., Duan R.C., Hu J. (2008). Mutation in the splicing factor Hprp3p linked to retinitis pigmentosa impairs interactions within the U4/U6 snRNP complex. Hum. Mol. Genet. 17: 225—239. PMID 17932117 DOI:10.1093/hmg/ddm300
- Horowitz D.S., Kobayashi R., Krainer A.R. (1997). A new cyclophilin and the human homologues of yeast Prp3 and Prp4 form a complex associated with U4/U6 snRNPs. RNA. 3: 1374—1387. PMID 9404889
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з PRPF3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17348 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O43395 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |