PRPF3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1X4Q, 3JCR

Ідентифікатори

Символи

PRPF3, pre-mRNA processing factor 3, HPRP3, HPRP3P, PRP3, Prp3p, RP18, SNRNP90

Зовнішні ІД

OMIM: 607301 MGI: 1918017 HomoloGene: 3447 GeneCards: PRPF3

Пов'язані генетичні захворювання

retinitis pigmentosa 18^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • RNA binding
Клітинна компонента	• Тільце Кахаля • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • nuclear speck • GO:0009327 protein-containing complex • U2-type precatalytic spliceosome
Біологічний процес	• RNA splicing, via transesterification reactions • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • spliceosomal tri-snRNP complex assembly • Сплайсинг РНК
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9129


70767

Ensembl


ENSG00000117360


ENSMUSG00000015748

UniProt


O43395


Q922U1

RefSeq (мРНК)


NM_004698 NM_001350529


NM_027541 NM_001316751

RefSeq (білок)


NP_004689 NP_001337458


NP_001303680 NP_081817

Локус (UCSC)

Хр. 1: 150.32 – 150.35 Mb

Хр. 3: 95.74 – 95.76 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PRPF3 (англ. Pre-mRNA processing factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 683 амінокислот, а молекулярна маса — 77 529^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALSKRELDE	LKPWIEKTVK	RVLGFSEPTV	VTAALNCVGK	GMDKKKAADH
LKPFLDDSTL	RFVDKLFEAV	EEGRSSRHSK	SSSDRSRKRE	LKEVFGDDSE
ISKESSGVKK	RRIPRFEEVE	EEPEVIPGPP	SESPGMLTKL	QIKQMMEAAT
RQIEERKKQL	SFISPPTPQP	KTPSSSQPER	LPIGNTIQPS	QAATFMNDAI
EKARKAAELQ	ARIQAQLALK	PGLIGNANMV	GLANLHAMGI	APPKVELKDQ
TKPTPLILDE	QGRTVDATGK	EIELTHRMPT	LKANIRAVKR	EQFKQQLKEK
PSEDMESNTF	FDPRVSIAPS	QRQRRTFKFH	DKGKFEKIAQ	RLRTKAQLEK
LQAEISQAAR	KTGIHTSTRL	ALIAPKKELK	EGDIPEIEWW	DSYIIPNGFD
LTEENPKRED	YFGITNLVEH	PAQLNPPVDN	DTPVTLGVYL	TKKEQKKLRR
QTRREAQKEL	QEKVRLGLMP	PPEPKVRISN	LMRVLGTEAV	QDPTKVEAHV
RAQMAKRQKA	HEEANAARKL	TAEQRKVKKI	KKLKEDISQG	VHISVYRVRN
LSNPAKKFKI	EANAGQLYLT	GVVVLHKDVN	VVVVEGGPKA	QKKFKRLMLH
RIKWDEQTSN	TKGDDDEESD	EEAVKKTNKC	VLVWEGTAKD	RSFGEMKFKQ
CPTENMAREH	FKKHGAEHYW	DLALSESVLE	STD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Medenbach J., Schreiner S., Liu S., Luhrmann R., Bindereif A. (2004). Human U4/U6 snRNP recycling factor p110: mutational analysis reveals the function of the tetratricopeptide repeat domain in recycling. Mol. Cell. Biol. 24: 7392—7401. PMID 15314151 DOI:10.1128/MCB.24.17.7392-7401.2004
Liu S., Rauhut R., Vornlocher H.-P., Luehrmann R. (2006). The network of protein-protein interactions within the human U4/U6.U5 tri-snRNP. RNA. 12: 1418—1430. PMID 16723661 DOI:10.1261/rna.55406
Gonzalez-Santos J.M., Cao H., Duan R.C., Hu J. (2008). Mutation in the splicing factor Hprp3p linked to retinitis pigmentosa impairs interactions within the U4/U6 snRNP complex. Hum. Mol. Genet. 17: 225—239. PMID 17932117 DOI:10.1093/hmg/ddm300
Horowitz D.S., Kobayashi R., Krainer A.R. (1997). A new cyclophilin and the human homologues of yeast Prp3 and Prp4 form a complex associated with U4/U6 snRNPs. RNA. 3: 1374—1387. PMID 9404889

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PRPF3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17348 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O43395 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.