PER2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3GDI, 4CT0, 4U8H

Ідентифікатори

Символи

PER2, FASPS, FASPS1, period circadian clock 2, period circadian regulator 2

Зовнішні ІД

OMIM: 603426 MGI: 1195265 HomoloGene: 7885 GeneCards: PER2

Пов'язані генетичні захворювання

advanced sleep phase syndrome^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transcription corepressor binding • transcription factor binding
Клітинна компонента	• ядерце • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро • цитоплазма
Біологічний процес	• histone H3 deacetylation • глюконеогенез • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of insulin secretion • ритмічний процес • negative regulation of fat cell proliferation • negative regulation of circadian rhythm • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • circadian regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • fatty acid metabolic process • regulation of cell cycle • negative regulation of protein ubiquitination • circadian regulation of translation • response to ischemia • regulation of vasoconstriction • glycogen biosynthetic process • negative regulation of transcription regulatory region DNA binding • regulation of circadian rhythm • циркадний ритм • white fat cell differentiation • regulation of glutamate uptake involved in transmission of nerve impulse • lactate biosynthetic process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • regulation of neurogenesis • positive regulation of nucleic acid-templated transcription • response to light stimulus • entrainment of circadian clock by photoperiod • positive regulation of cold-induced thermogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8864


18627

Ensembl


ENSG00000132326


ENSMUSG00000055866

UniProt


O15055


O54943

RefSeq (мРНК)


NM_003894 NM_022817


NM_011066

RefSeq (білок)


NP_073728


NP_035196

Локус (UCSC)

Хр. 2: 238.24 – 238.29 Mb

Хр. 1: 91.34 – 91.39 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PER2 (англ. Period circadian clock 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 255 амінокислот, а молекулярна маса — 136 579^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNGYAEFPPS	PSNPTKEPVE	PQPSQVPLQE	DVDMSSGSSG	HETNENCSTG
RDSQGSDCDD	SGKELGMLVE	PPDARQSPDT	FSLMMAKSEH	NPSTSGCSSD
QSSKVDTHKE	LIKTLKELKV	HLPADKKAKG	KASTLATLKY	ALRSVKQVKA
NEEYYQLLMS	SEGHPCGADV	PSYTVEEMES	VTSEHIVKNA	DMFAVAVSLV
SGKILYISDQ	VASIFHCKRD	AFSDAKFVEF	LAPHDVGVFH	SFTSPYKLPL
WSMCSGADSF	TQECMEEKSF	FCRVSVRKSH	ENEIRYHPFR	MTPYLVKVRD
QQGAESQLCC	LLLAERVHSG	YEAPRIPPEK	RIFTTTHTPN	CLFQDVDERA
VPLLGYLPQD	LIETPVLVQL	HPSDRPLMLA	IHKKILQSGG	QPFDYSPIRF
RARNGEYITL	DTSWSSFINP	WSRKISFIIG	RHKVRVGPLN	EDVFAAHPCT
EEKALHPSIQ	ELTEQIHRLL	LQPVPHSGSS	GYGSLGSNGS	HEHLMSQTSS
SDSNGHEDSR	RRRAEICKNG	NKTKNRSHYS	HESGEQKKKS	VTEMQTNPPA
EKKAVPAMEK	DSLGVSFPEE	LACKNQPTCS	YQQISCLDSV	IRYLESCNEA
ATLKRKCEFP	ANVPALRSSD	KRKATVSPGP	HAGEAEPPSR	VNSRTGVGTH
LTSLALPGKA	ESVASLTSQC	SYSSTIVHVG	DKKPQPELEM	VEDAASGPES
LDCLAGPALA	CGLSQEKEPF	KKLGLTKEVL	AAHTQKEEQS	FLQKFKEIRK
LSIFQSHCHY	YLQERSKGQP	SERTAPGLRN	TSGIDSPWKK	TGKNRKLKSK
RVKPRDSSES	TGSGGPVSAR	PPLVGLNATA	WSPSDTSQSS	CPAVPFPAPV
PAAYSLPVFP	APGTVAAPPA	PPHASFTVPA	VPVDLQHQFA	VQPPPFPAPL
APVMAFMLPS	YSFPSGTPNL	PQAFFPSQPQ	FPSHPTLTSE	MASASQPEFP
SRTSIPRQPC	ACPATRATPP	SAMGRASPPL	FQSRSSSPLQ	LNLLQLEEAP
EGGTGAMGTT	GATETAAVGA	DCKPGTSRDQ	QPKAPLTRDE	PSDTQNSDAL
STSSGLLNLL	LNEDLCSASG	SAASESLGSG	SLGCDASPSG	AGSSDTSHTS
KYFGSIDSSE	NNHKAKMNTG	MEESEHFIKC	VLQDPIWLLM	ADADSSVMMT
YQLPSRNLEA	VLKEDREKLK	LLQKLQPRFT	ESQKQELREV	HQWMQTGGLP
AAIDVAECVY	CENKEKGNIC	IPYEEDIPSL	GLSEVSDTKE	DENGSPLNHR
IEEQT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Shearman L.P., Zylka M.J., Weaver D.R., Kolakowski L.F. Jr., Reppert S.M. (1997). Two period homologs: circadian expression and photic regulation in the suprachiasmatic nuclei. Neuron. 19: 1261—1269. PMID 9427249 DOI:10.1016/S0896-6273(00)80417-1
Eckel-Mahan K., Sassone-Corsi P. (2013). Metabolism and the circadian clock converge. Physiol. Rev. 93: 107—135. PMID 23303907 DOI:10.1152/physrev.00016.2012
Partch C.L., Green C.B., Takahashi J.S. (2014). Molecular architecture of the mammalian circadian clock. Trends Cell Biol. 24: 90—99. PMID 23916625 DOI:10.1016/j.tcb.2013.07.002

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PER2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8846 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, O15055 (англ.) . Архів оригіналу за 19 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.