NAIP

NAIP
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2VM5

Ідентифікатори
Символи NAIP, BIRC1, NLRB1, psiNLR family, apoptosis inhibitory protein, NLR family apoptosis inhibitory protein
Зовнішні ІД OMIM: 600355 MGI: 1298226 HomoloGene: 136092 GeneCards: NAIP
Онтологія гена
Молекулярна функція

peptidase inhibitor activity
nucleotide binding
cysteine-type endopeptidase inhibitor activity
зв'язування з іоном металу
GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
ATP binding
cysteine-type endopeptidase inhibitor activity involved in apoptotic process

Клітинна компонента

перикаріон
neuronal cell body
basolateral plasma membrane
neuron projection
цитоплазма
клітинне ядро

Біологічний процес

GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process
negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
response to amino acid
negative regulation of peptidase activity
процес імунної системи
нейробіологія розвитку
response to axon injury
вроджений імунітет
inflammatory response
GO:0097285 апоптоз
Убіквітин-залежний протеоліз
positive regulation of canonical Wnt signaling pathway
mitotic spindle assembly
inhibition of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
negative regulation of apoptotic process

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4671
17948
Ensembl
ENSG00000278613
ENSG00000276068
ENSG00000249437
ENSMUSG00000078945
UniProt
Q13075
Q9QUK4
RefSeq (мРНК)
NM_004536
NM_022892
NM_001346870
NM_001126182
NM_010872
RefSeq (білок)
NP_001333799
NP_004527
NP_075043
NP_001119654
NP_035002
Локус (UCSC) Хр. 5: 70.97 – 71.03 Mb Хр. 13: 100.28 – 100.34 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NAIP (англ. NLR family apoptosis inhibitory protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 403 амінокислот, а молекулярна маса — 159 582[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MATQQKASDERISQFDHNLLPELSALLGLDAVQLAKELEEEEQKERAKMQ
KGYNSQMRSEAKRLKTFVTYEPYSSWIPQEMAAAGFYFTGVKSGIQCFCC
SLILFGAGLTRLPIEDHKRFHPDCGFLLNKDVGNIAKYDIRVKNLKSRLR
GGKMRYQEEEARLASFRNWPFYVQGISPCVLSEAGFVFTGKQDTVQCFSC
GGCLGNWEEGDDPWKEHAKWFPKCEFLRSKKSSEEITQYIQSYKGFVDIT
GEHFVNSWVQRELPMASAYCNDSIFAYEELRLDSFKDWPRESAVGVAALA
KAGLFYTGIKDIVQCFSCGGCLEKWQEGDDPLDDHTRCFPNCPFLQNMKS
SAEVTPDLQSRGELCELLETTSESNLEDSIAVGPIVPEMAQGEAQWFQEA
KNLNEQLRAAYTSASFRHMSLLDISSDLATDHLLGCDLSIASKHISKPVQ
EPLVLPEVFGNLNSVMCVEGEAGSGKTVLLKKIAFLWASGCCPLLNRFQL
VFYLSLSSTRPDEGLASIICDQLLEKEGSVTEMCVRNIIQQLKNQVLFLL
DDYKEICSIPQVIGKLIQKNHLSRTCLLIAVRTNRARDIRRYLETILEIK
AFPFYNTVCILRKLFSHNMTRLRKFMVYFGKNQSLQKIQKTPLFVAAICA
HWFQYPFDPSFDDVAVFKSYMERLSLRNKATAEILKATVSSCGELALKGF
FSCCFEFNDDDLAEAGVDEDEDLTMCLMSKFTAQRLRPFYRFLSPAFQEF
LAGMRLIELLDSDRQEHQDLGLYHLKQINSPMMTVSAYNNFLNYVSSLPS
TKAGPKIVSHLLHLVDNKESLENISENDDYLKHQPEISLQMQLLRGLWQI
CPQAYFSMVSEHLLVLALKTAYQSNTVAACSPFVLQFLQGRTLTLGALNL
QYFFDHPESLSLLRSIHFPIRGNKTSPRAHFSVLETCFDKSQVPTIDQDY
ASAFEPMNEWERNLAEKEDNVKSYMDMQRRASPDLSTGYWKLSPKQYKIP
CLEVDVNDIDVVGQDMLEILMTVFSASQRIELHLNHSRGFIESIRPALEL
SKASVTKCSISKLELSAAEQELLLTLPSLESLEVSGTIQSQDQIFPNLDK
FLCLKELSVDLEGNINVFSVIPEEFPNFHHMEKLLIQISAEYDPSKLVKL
IQNSPNLHVFHLKCNFFSDFGSLMTMLVSCKKLTEIKFSDSFFQAVPFVA
SLPNFISLKILNLEGQQFPDEETSEKFAYILGSLSNLEELILPTGDGIYR
VAKLIIQQCQQLHCLRVLSFFKTLNDDSVVEIAKVAISGGFQKLENLKLS
INHKITEEGYRNFFQALDNMPNLQELDISRHFTECIKAQATTVKSLSQCV
LRLPRLIRLNMLSWLLDADDIALLNVMKERHPQSKYLTILQKWILPFSPI
IQK

Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібітор тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Dubrez-Daloz L., Dupoux A., Cartier J. (2008). IAPs: more than just inhibitors of apoptosis proteins. Cell Cycle. 7: 1036—1046. PMID 18414036 DOI:10.4161/cc.7.8.5783
  • Karimpour S., Davoodi J., Ghahremani M.H. (2011). Integrity of ATP binding site is essential for effective inhibition of the intrinsic apoptosis pathway by NAIP. Biochem. Biophys. Res. Commun. 407: 158—162. PMID 21371431 DOI:10.1016/j.bbrc.2011.02.130
  • Katagiri N., Shobuike T., Chang B., Kukita A., Miyamoto H. (2012). The human apoptosis inhibitor NAIP induces pyroptosis in macrophages infected with Legionella pneumophila. Microbes Infect. 14: 1123—1132. PMID 22504023 DOI:10.1016/j.micinf.2012.03.006

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7634 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.
  4. UniProt, Q13075 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 5
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»