LEMD3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2CH0

Ідентифікатори

Символи

LEMD3, MAN1, LEM domain containing 3, LEM domain-containing protein 3

Зовнішні ІД

OMIM: 607844 MGI: 3580376 HomoloGene: 8633 GeneCards: LEMD3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • chromatin DNA binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • nuclear inner membrane • мембрана • клітинне ядро • ядерна мембрана • integral component of nuclear inner membrane
Біологічний процес	• negative regulation of activin receptor signaling pathway • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • negative regulation of BMP signaling pathway • nuclear envelope organization • meiotic attachment of telomere to nuclear envelope • Ангіогенез • nucleus organization • regulation of intracellular signal transduction
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23592


380664

Ensembl


ENSG00000174106


ENSMUSG00000048661

UniProt


Q9Y2U8


Q9WU40

RefSeq (мРНК)


NM_014319 NM_001167614


NM_001081193

RefSeq (білок)


NP_001161086 NP_055134 NP_055134.2


NP_001074662

Локус (UCSC)

Хр. 12: 65.17 – 65.25 Mb

Хр. 10: 120.76 – 120.82 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LEMD3 (англ. LEM domain containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 911 амінокислот, а молекулярна маса — 99 997^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAAAASAPQ	QLSDEELFSQ	LRRYGLSPGP	VTESTRPVYL	KKLKKLREEE
QQQHRSGGRG	NKTRNSNNNN	TAAATVAAAG	PAAAAAAGMG	VRPVSGDLSY
LRTPGGLCRI	SASGPESLLG	GPGGASAAPA	AGSKVLLGFS	SDESDVEASP
RDQAGGGGRK	DRASLQYRGL	KAPPAPLAAS	EVTNSNSAER	RKPHSWWGAR
RPAGPELQTP	PGKDGAVEDE	EGEGEDGEER	DPETEEPLWA	SRTVNGSRLV
PYSCRENYSD	SEEEDDDDVA	SSRQVLKDDS	LSRHRPRRTH	SKPLPPLTAK
SAGGRLETSV	QGGGGLAMND	RAAAAGSLDR	SRNLEEAAAA	EQGGGCDQVD
SSPVPRYRVN	AKKLTPLLPP	PLTDMDSTLD	SSTGSLLKTN	NHIGGGAFSV
DSPRIYSNSL	PPSAAVAASS	SLRINHANHT	GSNHTYLKNT	YNKPKLSEPE
EELLQQFKRE	EVSPTGSFSA	HYLSMFLLTA	ACLFFLILGL	TYLGMRGTGV
SEDGELSIEN	PFGETFGKIQ	ESEKTLMMNT	LYKLHDRLAQ	LAGDHECGSS
SQRTLSVQEA	AAYLKDLGPE	YEGIFNTSLQ	WILENGKDVG	IRCVGFGPEE
ELTNITDVQF	LQSTRPLMSF	WCRFRRAFVT	VTHRLLLLCL	GVVMVCVVLR
YMKYRWTKEE	EETRQMYDMV	VKIIDVLRSH	NEACQENKDL	QPYMPIPHVR
DSLIQPHDRK	KMKKVWDRAV	DFLAANESRV	RTETRRIGGA	DFLVWRWIQP
SASCDKILVI	PSKVWQGQAF	HLDRRNSPPN	SLTPCLKIRN	MFDPVMEIGD
QWHLAIQEAI	LEKCSDNDGI	VHIAVDKNSR	EGCVYVKCLS	PEYAGKAFKA
LHGSWFDGKL	VTVKYLRLDR	YHHRFPQALT	SNTPLKPSNK	HMNSMSHLRL
RTGLTNSQGS	S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, мембрані.

Література

Lin F., Morrison J.M., Wu W., Worman H.J. (2005). MAN1, an integral protein of the inner nuclear membrane, binds Smad2 and Smad3 and antagonizes transforming growth factor-beta signaling. Hum. Mol. Genet. 14: 437—445. PMID 15601644 DOI:10.1093/hmg/ddi040

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28887 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y2U8 (англ.) . Архів оригіналу за 12 жовтня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.