IGSF9 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | IGSF9, FP18798, IGSF9A, Nrt1, immunoglobulin superfamily member 9 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609738 MGI: 2135283 HomoloGene: 10815 GeneCards: IGSF9 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • cell-cell adhesion mediator activity |
---|
Клітинна компонента | • міжклітинні контакти • integral component of membrane • аксон • синапс • клітинна мембрана • дендрит (нейробіологія) • inhibitory synapse • мембрана |
---|
Біологічний процес | • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • multicellular organism development • диференціація клітин • нейробіологія розвитку • GO:1904739 regulation of synapse organization • dendrite development • axon guidance • dendrite self-avoidance |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 159.93 – 159.95 Mb | Хр. 1: 172.48 – 172.5 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
IGSF9 (англ. Immunoglobulin superfamily member 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 179 амінокислот, а молекулярна маса — 126 580[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MVWCLGLAVL | | SLVISQGADG | | RGKPEVVSVV | | GRAGESVVLG | | CDLLPPAGRP |
PLHVIEWLRF | | GFLLPIFIQF | | GLYSPRIDPD | | YVGRVRLQKG | | ASLQIEGLRV |
EDQGWYECRV | | FFLDQHIPED | | DFANGSWVHL | | TVNSPPQFQE | | TPPAVLEVQE |
LEPVTLRCVA | | RGSPLPHVTW | | KLRGKDLGQG | | QGQVQVQNGT | | LRIRRVERGS |
SGVYTCQASS | | TEGSATHATQ | | LLVLGPPVIV | | VPPKNSTVNA | | SQDVSLACHA |
EAYPANLTYS | | WFQDNINVFH | | ISRLQPRVRI | | LVDGSLRLLA | | TQPDDAGCYT |
CVPSNGLLHP | | PSASAYLTVL | | YPAQVTAMPP | | ETPLPIGMPG | | VIRCPVRANP |
PLLFVSWTKD | | GKALQLDKFP | | GWSQGTEGSL | | IIALGNEDAL | | GEYSCTPYNS |
LGTAGPSPVT | | RVLLKAPPAF | | IERPKEEYFQ | | EVGRELLIPC | | SAQGDPPPVV |
SWTKVGRGLQ | | GQAQVDSNSS | | LILRPLTKEA | | HGHWECSASN | | AVARVATSTN |
VYVLGTSPHV | | VTNVSVVALP | | KGANVSWEPG | | FDGGYLQRFS | | VWYTPLAKRP |
DRMHHDWVSL | | AVPVGAAHLL | | VPGLQPHTQY | | QFSVLAQNKL | | GSGPFSEIVL |
SAPEGLPTTP | | AAPGLPPTEI | | PPPLSPPRGL | | VAVRTPRGVL | | LHWDPPELVP |
KRLDGYVLEG | | RQGSQGWEVL | | DPAVAGTETE | | LLVPGLIKDV | | LYEFRLVAFA |
GSFVSDPSNT | | ANVSTSGLEV | | YPSRTQLPGL | | LPQPVLAGVV | | GGVCFLGVAV |
LVSILAGCLL | | NRRRAARRRR | | KRLRQDPPLI | | FSPTGKSAAP | | SALGSGSPDS |
VAKLKLQGSP | | VPSLRQSLLW | | GDPAGTPSPH | | PDPPSSRGPL | | PLEPICRGPD |
GRFVMGPTVA | | APQERSGREQ | | AEPRTPAQRL | | ARSFDCSSSS | | PSGAPQPLCI |
EDISPVAPPP | | AAPPSPLPGP | | GPLLQYLSLP | | FFREMNVDGD | | WPPLEEPSPA |
APPDYMDTRR | | CPTSSFLRSP | | ETPPVSPRES | | LPGAVVGAGA | | TAEPPYTALA |
DWTLRERLLP | | GLLPAAPRGS | | LTSQSSGRGS | | ASFLRPPSTA | | PSAGGSYLSP |
APGDTSSWAS | | GPERWPRREH | | VVTVSKRRNT | | SVDENYEWDS | | EFPGDMELLE |
TLHLGLASSR | | LRPEAEPELG | | VKTPEEGCLL | | NTAHVTGPEA | | RCAALREEFL |
AFRRRRDATR | | ARLPAYRQPV | | PHPEQATLL |
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18132 (англ.) . Архів оригіналу за 20 червня 2017. Процитовано 15 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9P2J2 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 15 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |