HERPUD1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | HERPUD1, HERP, Mif1, SUP, homocysteine inducible ER protein with ubiquitin like domain 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608070 MGI: 1927406 HomoloGene: 40973 GeneCards: HERPUD1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
метаболічні захворювання[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • transmembrane transporter binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • молекулярна функція • ubiquitin ligase-substrate adaptor activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • Lewy body core • Кальцієві канали • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway • regulation of protein ubiquitination • regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway • cellular calcium ion homeostasis • endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis • response to endoplasmic reticulum stress • PERK-mediated unfolded protein response • positive regulation of ER-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of ER-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process • response to unfolded protein • retrograde protein transport, ER to cytosol • positive regulation of protein binding • Відповідь на незгорнуті білки • Убіквітин-залежний протеоліз |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001010989 NM_001010990 NM_001272103 NM_014685 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001010989 NP_001259032 NP_055500 NP_001259032.1 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 56.93 – 56.94 Mb | Хр. 8: 95.11 – 95.12 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
HERPUD1 (англ. Homocysteine inducible ER protein with ubiquitin like domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 391 амінокислот, а молекулярна маса — 43 720[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MESETEPEPV | | TLLVKSPNQR | | HRDLELSGDR | | GWSVGHLKAH | | LSRVYPERPR |
PEDQRLIYSG | | KLLLDHQCLR | | DLLPKQEKRH | | VLHLVCNVKS | | PSKMPEINAK |
VAESTEEPAG | | SNRGQYPEDS | | SSDGLRQREV | | LRNLSSPGWE | | NISRPEAAQQ |
AFQGLGPGFS | | GYTPYGWLQL | | SWFQQIYARQ | | YYMQYLAATA | | ASGAFVPPPS |
AQEIPVVSAP | | APAPIHNQFP | | AENQPANQNA | | APQVVVNPGA | | NQNLRMNAQG |
GPIVEEDDEI | | NRDWLDWTYS | | AATFSVFLSI | | LYFYSSLSRF | | LMVMGATVVM |
YLHHVGWFPF | | RPRPVQNFPN | | DGPPPDVVNQ | | DPNNNLQEGT | | DPETEDPNHL |
PPDRDVLDGE | | QTSPSFMSTA | | WLVFKTFFAS | | LLPEGPPAIA | | N |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як відповідь на порушення конформації білку, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.
Література
- Kokame K., Agarwala K.L., Kato H., Miyata T. (2000). Herp, a new ubiquitin-like membrane protein induced by endoplasmic reticulum stress. J. Biol. Chem. 275: 32846—32853. PMID 10922362 DOI:10.1074/jbc.M002063200
- Kokame K., Kato H., Miyata T. (2001). Identification of ERSE-II, a new cis-acting element responsible for the ATF6-dependent mammalian unfolded protein response. J. Biol. Chem. 276: 9199—9205. PMID 11112790 DOI:10.1074/jbc.M010486200
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kim T.Y., Kim E., Yoon S.K., Yoon J.B. (2008). Herp enhances ER-associated protein degradation by recruiting ubiquilins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 369: 741—746. PMID 18307982 DOI:10.1016/j.bbrc.2008.02.086
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з HERPUD1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13744 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q15011 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |