GDA |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4AQL, 3E0L, 2UZ9 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | GDA, guanine deaminase, CYPIN, GUANASE, NEDASIN, Guanine deaminase, GAH |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 139260 MGI: 95678 HomoloGene: 3171 GeneCards: GDA |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds • zinc ion binding • guanine deaminase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • гіалоплазма • внутрішньоклітинний |
---|
Біологічний процес | • guanine catabolic process • purine nucleotide catabolic process • nucleobase-containing compound metabolic process • нейробіологія розвитку • guanine metabolic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001242505 NM_001242506 NM_001242507 NM_004293 NM_001351571
| NM_001351572 NM_001351573 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001229434 NP_001229435 NP_001229436 NP_004284 NP_001338500
| NP_001338501 NP_001338502 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 72.11 – 72.26 Mb | Хр. 19: 21.37 – 21.45 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
GDA (англ. Guanine deaminase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 454 амінокислот, а молекулярна маса — 51 003[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MCAAQMPPLA | | HIFRGTFVHS | | TWTCPMEVLR | | DHLLGVSDSG | | KIVFLEEASQ |
QEKLAKEWCF | | KPCEIRELSH | | HEFFMPGLVD | | THIHASQYSF | | AGSSIDLPLL |
EWLTKYTFPA | | EHRFQNIDFA | | EEVYTRVVRR | | TLKNGTTTAC | | YFATIHTDSS |
LLLADITDKF | | GQRAFVGKVC | | MDLNDTFPEY | | KETTEESIKE | | TERFVSEMLQ |
KNYSRVKPIV | | TPRFSLSCSE | | TLMGELGNIA | | KTRDLHIQSH | | ISENRDEVEA |
VKNLYPSYKN | | YTSVYDKNNL | | LTNKTVMAHG | | CYLSAEELNV | | FHERGASIAH |
CPNSNLSLSS | | GFLNVLEVLK | | HEVKIGLGTD | | VAGGYSYSML | | DAIRRAVMVS |
NILLINKVNE | | KSLTLKEVFR | | LATLGGSQAL | | GLDGEIGNFE | | VGKEFDAILI |
NPKASDSPID | | LFYGDFFGDI | | SEAVIQKFLY | | LGDDRNIEEV | | YVGGKQVVPF |
SSSV |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.
Література
- Yuan G., Bin J.C., McKay D.J., Snyder F.F. (1999). Cloning and characterization of human guanine deaminase. Purification and partial amino acid sequence of the mouse protein. J. Biol. Chem. 274: 8175—8180. PMID 10075721 DOI:10.1074/jbc.274.12.8175
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Murphy P.M., Bolduc J.M., Gallaher J.L., Stoddard B.L., Baker D. (2009). Alteration of enzyme specificity by computational loop remodeling and design. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106: 9215—9220. PMID 19470646 DOI:10.1073/pnas.0811070106
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4212 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y2T3 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |