FABP5

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1B56, 1JJJ, 4AZM, 4AZR, 4LKP, 4LKT

Ідентифікатори

Символи

FABP5, E-FABP, EFABP, KFABP, PA-FABP, PAFABP, fatty acid binding protein 5

Зовнішні ІД

OMIM: 605168 MGI: 101790 HomoloGene: 108238 GeneCards: FABP5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transporter activity • lipid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • fatty acid binding • retinoic acid binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • нуклеоплазма • гіалоплазма • екзосома • extracellular region • клітинна мембрана • secretory granule membrane • azurophil granule lumen • міжклітинний простір • клітинне ядро • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • мембрана • міжклітинні контакти • синапс • postsynaptic membrane
Біологічний процес	• epidermis development • triglyceride catabolic process • phosphatidylcholine biosynthetic process • glucose metabolic process • lipid metabolism • neutrophil degranulation • GO:0015915 транспорт • negative regulation of glucose transmembrane transport • regulation of prostaglandin biosynthetic process • positive regulation of peroxisome proliferator activated receptor signaling pathway • glucose homeostasis • regulation of sensory perception of pain • regulation of retrograde trans-synaptic signaling by endocanabinoid • positive regulation of cold-induced thermogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2171


16592

Ensembl


ENSG00000164687


ENSMUSG00000027533

UniProt


Q01469


Q05816

RefSeq (мРНК)


NM_001444


NM_001272097 NM_001272098 NM_010634

RefSeq (білок)


NP_001435


NP_001259026 NP_001259027 NP_034764

Локус (UCSC)

Хр. 8: 81.28 – 81.28 Mb

Хр. 3: 10.08 – 10.08 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

FABP5 (англ. Fatty acid binding protein 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 135 амінокислот, а молекулярна маса — 15 164^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATVQQLEGR	WRLVDSKGFD	EYMKELGVGI	ALRKMGAMAK	PDCIITCDGK
NLTIKTESTL	KTTQFSCTLG	EKFEETTADG	RKTQTVCNFT	DGALVQHQEW
DGKESTITRK	LKDGKLVVEC	VMNNVTCTRI	YEKVE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Madsen P.S., Rasmussen H.H., Leffers H., Honore B., Celis J.E. (1992). Molecular cloning and expression of a novel keratinocyte protein (psoriasis-associated fatty acid-binding protein [PA-FABP]) that is highly up-regulated in psoriatic skin and that shares similarity to fatty acid-binding proteins. J. Invest. Dermatol. 99: 299—305. PMID 1512466 DOI:10.1111/1523-1747.ep12616641
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hohoff C., Borchers T., Rustow B., Spener F., van Tilbeurgh H. (1999). Expression, purification and crystal structure determination of recombinant human epidermal-type fatty acid-binding protein. Biochemistry. 38: 12229—12239. PMID 10493790 DOI:10.1021/bi990305u

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3560 (англ.) . Архів оригіналу за 21 квітня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q01469 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.