DHFR

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1BOZ, 1DHF, 1DLR, 1DLS, 1DRF, 1HFP, 1HFQ, 1HFR, 1KMS, 1KMV, 1MVS, 1MVT, 1OHJ, 1OHK, 1PD8, 1PD9, 1PDB, 1S3U, 1S3V, 1S3W, 1U71, 1U72, 1YHO, 2C2S, 2C2T, 2DHF, 2W3A, 2W3B, 2W3M, 3EIG, 3F8Y, 3F8Z, 3F91, 3FS6, 3GHC, 3GHV, 3GHW, 3GI2, 3GYF, 3L3R, 3N0H, 3NTZ, 3NU0, 3NXO, 3NXR, 3NXT, 3NXV, 3NXX, 3NXY, 3NZD, 3OAF, 3S3V, 3S7A, 4DDR, 4G95, 4KAK, 4KBN, 4KD7, 4KEB, 4KFJ, 4M6J, 4M6K, 4M6L, 4QHV, 4QJC

Ідентифікатори

Символи

DHFR, DHFRP1, DYR, dihydrofolate reductase

Зовнішні ІД

OMIM: 126060 MGI: 94890 HomoloGene: 56470 GeneCards: DHFR

Пов'язані генетичні захворювання

constitutional megaloblastic anemia with severe neurologic disease^[1]

Реагує на сполуку

метотрексат, pemetrexed, pralatrexate, триметрексат, piritrexim^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• methotrexate binding • folic acid binding • dihydrofolate reductase activity • NADPH binding • RNA binding • oxidoreductase activity • mRNA binding • folate reductase activity • translation repressor activity, mRNA regulatory element binding • sequence-specific mRNA binding • NADP binding
Клітинна компонента	• гіалоплазма • цитоплазма • мітохондрія • компонент клітини
Біологічний процес	• response to methotrexate • dihydrofolate metabolic process • one-carbon metabolic process • axon regeneration • regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle • tetrahydrofolate metabolic process • tetrahydrofolate biosynthetic process • positive regulation of nitric-oxide synthase activity • folic acid metabolic process • tetrahydrobiopterin biosynthetic process • regulation of removal of superoxide radicals • negative regulation of translation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1719


13361

Ensembl


ENSG00000228716


ENSMUSG00000021707

UniProt


P00374


P00375

RefSeq (мРНК)


NM_000791 NM_001290354 NM_001290357


NM_010049

RefSeq (білок)


NP_000782 NP_001277283 NP_001277286


NP_034179

Локус (UCSC)

Хр. 5: 80.63 – 80.65 Mb

Хр. 13: 92.49 – 92.53 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DHFR (англ. Dihydrofolate reductase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 187 амінокислот, а молекулярна маса — 21 453^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVGSLNCIVA	VSQNMGIGKN	GDLPWPPLRN	EFRYFQRMTT	TSSVEGKQNL
VIMGKKTWFS	IPEKNRPLKG	RINLVLSREL	KEPPQGAHFL	SRSLDDALKL
TEQPELANKV	DMVWIVGGSS	VYKEAMNHPG	HLKLFVTRIM	QDFESDTFFP
EIDLEKYKLL	PEYPGVLSDV	QEEKGIKYKF	EVYEKND

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у таких біологічних процесах як одновуглецевий метаболізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК, НАДФ. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії.

Література

Masters J.N., Attardi G. (1983). The nucleotide sequence of the cDNA coding for the human dihydrofolic acid reductase. Gene. 21: 59—63. PMID 6687716 DOI:10.1016/0378-1119(83)90147-6
Yang J.K., Masters J.N., Attardi G. (1984). Human dihydrofolate reductase gene organization. Extensive conservation of the G + C-rich 5' non-coding sequence and strong intron size divergence from homologous mammalian genes. J. Mol. Biol. 176: 169—187. PMID 6235374 DOI:10.1016/0022-2836(84)90419-4
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Anderson D.D., Quintero C.M., Stover P.J. (2011). Identification of a de novo thymidylate biosynthesis pathway in mammalian mitochondria. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 15163—15168. PMID 21876188 DOI:10.1073/pnas.1103623108
Oefner C., D'Arcy A., Winkler F.K. (1988). Crystal structure of human dihydrofolate reductase complexed with folate. Eur. J. Biochem. 174: 377—385. PMID 3383852 DOI:10.1111/j.1432-1033.1988.tb14108.x
Cody V., Galitsky N., Luft J.R., Pangborn W., Gangjee A. (2003). Analysis of two polymorphic forms of a pyrido[2,3-d]pyrimidine N9-C10 reversed-bridge antifolate binary complex with human dihydrofolate reductase. Acta Crystallogr. D. 59: 654—661. PMID 12657784 DOI:10.1107/S0907444903001951

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з DHFR переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з DHFR переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2861 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P00374 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.