CNTN4

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3JXA, 3KLD

Ідентифікатори

Символи

CNTN4, AXCAM, BIG-2, contactin 4

Зовнішні ІД

OMIM: 607280 MGI: 1095737 HomoloGene: 14257 GeneCards: CNTN4

Пов'язані генетичні захворювання

бічний аміотрофічний склероз^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cell-cell adhesion mediator activity
Клітинна компонента	• anchored component of membrane • аксон • мембрана • extracellular region • клітинна мембрана
Біологічний процес	• neuron cell-cell adhesion • адгезія клітин • axonal fasciculation • negative regulation of neuron differentiation • аксоноґенеза • нейробіологія розвитку • regulation of synaptic plasticity • axon guidance • brain development • neuron projection development • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • dendrite self-avoidance
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


152330


269784

Ensembl


ENSG00000144619


ENSMUSG00000064293

UniProt


Q8IWV2


Q69Z26

RefSeq (мРНК)

NM_001206955 NM_001206956 NM_175607 NM_175612 NM_175613
NM_001350095


NM_001109749 NM_001109751 NM_173004 NM_001364565 NM_001364566

RefSeq (білок)


NP_001193884 NP_001193885 NP_783200 NP_783302 NP_001337024


NP_001103219 NP_001103221 NP_766592 NP_001351494 NP_001351495

Локус (UCSC)

Хр. 3: 2.1 – 3.06 Mb

Хр. 6: 105.68 – 106.7 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CNTN4 (англ. Contactin 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 026 амінокислот, а молекулярна маса — 113 454^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRLPWELLVL	QSFILCLADD	STLHGPIFIQ	EPSPVMFPLD	SEEKKVKLNC
EVKGNPKPHI	RWKLNGTDVD	TGMDFRYSVV	EGSLLINNPN	KTQDAGTYQC
TATNSFGTIV	SREAKLQFAY	LDNFKTRTRS	TVSVRRGQGM	VLLCGPPPHS
GELSYAWIFN	EYPSYQDNRR	FVSQETGNLY	IAKVEKSDVG	NYTCVVTNTV
TNHKVLGPPT	PLILRNDGVM	GEYEPKIEVQ	FPETVPTAKG	ATVKLECFAL
GNPVPTIIWR	RADGKPIARK	ARRHKSNGIL	EIPNFQQEDA	GLYECVAENS
RGKNVARGQL	TFYAQPNWIQ	KINDIHVAME	ENVFWECKAN	GRPKPTYKWL
KNGEPLLTRD	RIQIEQGTLN	ITIVNLSDAG	MYQCLAENKH	GVIFSNAELS
VIAVGPDFSR	TLLKRVTLVK	VGGEVVIECK	PKASPKPVYT	WKKGRDILKE
NERITISEDG	NLRIINVTKS	DAGSYTCIAT	NHFGTASSTG	NLVVKDPTRV
MVPPSSMDVT	VGESIVLPCQ	VTHDHSLDIV	FTWSFNGHLI	DFDRDGDHFE
RVGGQDSAGD	LMIRNIQLKH	AGKYVCMVQT	SVDRLSAAAD	LIVRGPPGPP
EAVTIDEITD	TTAQLSWRPG	PDNHSPITMY	VIQARTPFSV	GWQAVSTVPE
LIDGKTFTAT	VVGLNPWVEY	EFRTVAANVI	GIGEPSRPSE	KRRTEEALPE
VTPANVSGGG	GSKSELVITW	ETVPEELQNG	RGFGYVVAFR	PYGKMIWMLT
VLASADASRY	VFRNESVHPF	SPFEVKVGVF	NNKGEGPFSP	TTVVYSAEEE
PTKPPASIFA	RSLSATDIEV	FWASPLEKNR	GRIQGYEVKY	WRHEDKEENA
RKIRTVGNQT	STKITNLKGS	VLYHLAVKAY	NSAGTGPSSA	TVNVTTRKPP
PSQPPGNIIW	NSSDSKIILN	WDQVKALDNE	SEVKGYKVLY	RWNRQSSTSV
IETNKTSVEL	SLPFDEDYII	EIKPFSDGGD	GSSSEQIRIP	KISNAYARGS
GASTSNACTL	SAISTIMISL	TARSSL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bouyain S., Watkins D.J. (2010). The protein tyrosine phosphatases PTPRZ and PTPRG bind to distinct members of the contactin family of neural recognition molecules. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 2443—2448. PMID 20133774 DOI:10.1073/pnas.0911235107

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CNTN4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2174 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8IWV2 (англ.) . Архів оригіналу за 26 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.