CCL23

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1G91

Ідентифікатори

Символи

CCL23, CK-BETA-8, CKb8, Ckb-8, Ckb-8-1, MIP-3, MIP3, MPIF-1, SCYA23, hmrp-2a, C-C motif chemokine ligand 23

Зовнішні ІД

OMIM: 602494 MGI: 98263 HomoloGene: 89167 GeneCards: CCL23

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cytokine activity • heparin binding • chemokine activity • CCR1 chemokine receptor binding • CCR chemokine receptor binding
Клітинна компонента	• extracellular region • міжклітинний простір
Біологічний процес	• G protein-coupled receptor signaling pathway • monocyte chemotaxis • chemokine-mediated signaling pathway • cell-cell signaling • cellular response to tumor necrosis factor • cellular calcium ion homeostasis • neutrophil chemotaxis • хемотаксис • negative regulation of C-C chemokine binding • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • cellular response to interleukin-1 • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • cellular response to interferon-gamma • lymphocyte chemotaxis • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of cell population proliferation • inflammatory response • regulation of signaling receptor activity • eosinophil chemotaxis
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6368


20305

Ensembl


ENSG00000276114 ENSG00000274736


ENSMUSG00000018927

UniProt


P55773


P27784

RefSeq (мРНК)


NM_005064 NM_145898


NM_009139

RefSeq (білок)


NP_005055 NP_665905


NP_033165

Локус (UCSC)

Хр. 17: 36.01 – 36.02 Mb

Хр. 11: 83.48 – 83.48 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CCL23 (англ. C-C motif chemokine ligand 23) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 120 амінокислот, а молекулярна маса — 13 411^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKVSVAALSC	LMLVTALGSQ	ARVTKDAETE	FMMSKLPLEN	PVLLDRFHAT
SADCCISYTP	RSIPCSLLES	YFETNSECSK	PGVIFLTKKG	RRFCANPSDK
QVQVCVRMLK	LDTRIKTRKN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у таких біологічних процесах, як запальна відповідь, хемотаксис, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою гепарину. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Rajarathnam K., Li Y., Rohrer T., Gentz R. (2001). Solution structure and dynamics of myeloid progenitor inhibitory factor-1 (MPIF-1), a novel monomeric CC chemokine. J. Biol. Chem. 276: 4909—4916. PMID 11060285 DOI:10.1074/jbc.M005085200
Wells T.N.C., Peitsch M.C. (1997). The chemokine information source: identification and characterization of novel chemokines using the WorldWideWeb and expressed sequence tag databases. J. Leukoc. Biol. 61: 545—550. PMID 9129202

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10622 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.
↑ UniProt, P55773 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 21 вересня 2017.