CAPN9

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1ZIV, 2P0R

Ідентифікатори

Символи

CAPN9, GC36, nCL-4, calpain 9

Зовнішні ІД

OMIM: 606401 MGI: 1920897 HomoloGene: 38208 GeneCards: CAPN9

Пов'язані генетичні захворювання

короткозорість^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинний • цитоплазма • компонент клітини
Біологічний процес	• травлення • протеоліз • sarcomere organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10753


73647

Ensembl


ENSG00000135773


ENSMUSG00000031981

UniProt


O14815


Q9D805

RefSeq (мРНК)


NM_006615 NM_016452 NM_001319676


NM_023709

RefSeq (білок)


NP_001306605 NP_006606 NP_057536


NP_076198

Локус (UCSC)

Хр. 1: 230.75 – 230.8 Mb

Хр. 8: 125.3 – 125.35 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CAPN9 (англ. Calpain 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 690 амінокислот, а молекулярна маса — 79 097^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPYLYRAPGP	QAHPVPKDAR	ITHSSGQSFE	QMRQECLQRG	TLFEDADFPA
SNSSLFYSER	PQIPFVWKRP	GEIVKNPEFI	LGGATRTDIC	QGELGDCWLL
AAIASLTLNQ	KALARVIPQD	QSFGPGYAGI	FHFQFWQHSE	WLDVVIDDRL
PTFRDRLVFL	HSADHNEFWS	ALLEKAYAKL	NGSYEALKGG	SAIEAMEDFT
GGVAETFQTK	EAPENFYEIL	EKALKRGSLL	GCFIDTRSAA	ESEARTPFGL
IKGHAYSVTG	IDQVSFRGQR	IELIRIRNPW	GQVEWNGSWS	DSSPEWRSVG
PAEQKRLCHT	ALDDGEFWMA	FKDFKAHFDK	VEICNLTPDA	LEEDAIHKWE
VTVHQGSWVR	GSTAGGCRNF	LDTFWTNPQI	KLSLTEKDEG	QEECSFLVAL
MQKDRRKLKR	FGANVLTIGY	AIYECPDKDE	HLNKDFFRYH	ASRARSKTFI
NLREVSDRFK	LPPGEYILIP	STFEPHQEAD	FCLRIFSEKK	AITRDMDGNV
DIDLPEPPKP	TPPDQETEEE	QRFRALFEQV	AGEDMEVTAE	ELEYVLNAVL
QKKKDIKFKK	LSLISCKNII	SLMDTSGNGK	LEFDEFKVFW	DKLKQWINLF
LRFDADKSGT	MSTYELRTAL	KAAGFQLSSH	LLQLIVLRYA	DEELQLDFDD
FLNCLVRLEN	ASRVFQALST	KNKEFIHLNI	NEFIHLTMNI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію.

Література

Lee H.-J., Sorimachi H., Jeong S.-Y., Ishiura S., Suzuki K. (1998). Molecular cloning and characterization of a novel tissue-specific calpain predominantly expressed in the digestive tract. Biol. Chem. 379: 175—183. PMID 9524069 DOI:10.1515/bchm.1998.379.2.175
Yoshikawa Y., Mukai H., Hino F., Asada K., Kato I. (2000). Isolation of two novel genes, down-regulated in gastric cancer. Jpn. J. Cancer Res. 91: 459—463. PMID 10835488 DOI:10.1111/j.1349-7006.2000.tb00967.x

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CAPN9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1486 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, O14815 (англ.) . Архів оригіналу за 5 жовтня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.