ADAMTS1

ADAMTS1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2JIH, 2V4B, 3Q2G, 3Q2H

Ідентифікатори
Символи ADAMTS1, C3-C5, METH1, ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1
Зовнішні ІД OMIM: 605174 MGI: 109249 HomoloGene: 21381 GeneCards: ADAMTS1
Онтологія гена
Молекулярна функція

• heparin binding
• zinc ion binding
• зв'язування з іоном металу
• GO:0070122 peptidase activity
• metalloendopeptidase activity
• hydrolase activity
• metallopeptidase activity

Клітинна компонента

• extracellular region
• базальна мембрана
• GO:0016023 cytoplasmic vesicle
• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• collagen-containing extracellular matrix

Біологічний процес

• ovulation from ovarian follicle
• heart trabecula formation
• розвиток нирки
• протеоліз
• integrin-mediated signaling pathway
• negative regulation of cell population proliferation
• positive regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle
• positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation
• positive regulation of vascular associated smooth muscle cell migration

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
9510
11504
Ensembl
ENSG00000154734
ENSMUSG00000022893
UniProt
Q9UHI8
P97857
RefSeq (мРНК)
NM_006988
NM_009621
RefSeq (білок)
NP_008919
NP_033751
Локус (UCSC) Хр. 21: 26.84 – 26.85 Mb Хр. 16: 85.59 – 85.6 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ADAMTS1 (англ. ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 967 амінокислот, а молекулярна маса — 105 358[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MQRAVPEGFGRRKLGSDMGNAERAPGSRSFGPVPTLLLLAAALLAVSDAL
GRPSEEDEELVVPELERAPGHGTTRLRLHAFDQQLDLELRPDSSFLAPGF
TLQNVGRKSGSETPLPETDLAHCFYSGTVNGDPSSAAALSLCEGVRGAFY
LLGEAYFIQPLPAASERLATAAPGEKPPAPLQFHLLRRNRQGDVGGTCGV
VDDEPRPTGKAETEDEDEGTEGEDEGAQWSPQDPALQGVGQPTGTGSIRK
KRFVSSHRYVETMLVADQSMAEFHGSGLKHYLLTLFSVAARLYKHPSIRN
SVSLVVVKILVIHDEQKGPEVTSNAALTLRNFCNWQKQHNPPSDRDAEHY
DTAILFTRQDLCGSQTCDTLGMADVGTVCDPSRSCSVIEDDGLQAAFTTA
HELGHVFNMPHDDAKQCASLNGVNQDSHMMASMLSNLDHSQPWSPCSAYM
ITSFLDNGHGECLMDKPQNPIQLPGDLPGTSYDANRQCQFTFGEDSKHCP
DAASTCSTLWCTGTSGGVLVCQTKHFPWADGTSCGEGKWCINGKCVNKTD
RKHFDTPFHGSWGMWGPWGDCSRTCGGGVQYTMRECDNPVPKNGGKYCEG
KRVRYRSCNLEDCPDNNGKTFREEQCEAHNEFSKASFGSGPAVEWIPKYA
GVSPKDRCKLICQAKGIGYFFVLQPKVVDGTPCSPDSTSVCVQGQCVKAG
CDRIIDSKKKFDKCGVCGGNGSTCKKISGSVTSAKPGYHDIITIPTGATN
IEVKQRNQRGSRNNGSFLAIKAADGTYILNGDYTLSTLEQDIMYKGVVLR
YSGSSAALERIRSFSPLKEPLTIQVLTVGNALRPKIKYTYFVKKKKESFN
AIPTFSAWVIEEWGECSKSCELGWQRRLVECRDINGQPASECAKEVKPAS
TRPCADHPCPQWQLGEWSSCSKTCGKGYKKRSLKCLSHDGGVLSHESCDP
LKKPKHFIDFCTMAECS

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію, з молекулою гепарину. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

  • Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:217 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, Q9UHI8 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 21
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.
  • п
  • о
  • р
Протеази: металоендопептидази (EC 3.4.24)
Білки ADAM
Матриксні металопротеїнази

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.