Prosite
| URL | http://prosite.expasy.org/  |
|---|---|
| Tipus | base de dades biològica i base de dades en línia |
| Llengua | anglès |
| Part de | SIB Swiss Institute of Bioinformatics (en)  |
| Creador | Amos Bairoch |
| Mantenidor | SIB Swiss Institute of Bioinformatics (en) |
PROSITE és una base de dades de famílies de proteïnes i dominis proteics.
Aquesta base de dades consisteix en un conjunt d'entrades que recullen la descripció dels dominis, les famílies i els llocs funcionals, així com les seqüències d'aminoàcids característiques de les proteïnes d'interès. Prosite va ser creat el 1988 per Amos Bairoch i actualment és elaborada pel Swiss Institute of Bioinformatics.
Els seus usos més habituals inclouen la predicció de dominis i funcions per a noves proteïnes i l'anàlisi de proteïnes ja conegudes a la cerca de funcions no predites anteriorment. Prosite forma part de les eines d'anàlisi orientades a la proteòmica que ofereix el servidor ExPASy i està integrada en la base de dades de proteïnes Swiss-Prot
Vegeu també
- Uniprot
- InterPro
Referències
- Hulo N., Bairoch A., Bulliard V., Cerutti L., Cuche B., De Castro E., Lachaize C., Langendijk-Genevaux P.S., Sigrist C.J.A. «The 20 years of PROSITE.». Nucleic Acids Res., 2007. PMID: 18003654.
- De Castro E., Sigrist C.J.A., Gattiker A., Bulliard V., Langendijk-Genevaux P.S., Gasteiger E., Bairoch A., Hulo N. «ScanProsite: detection of PROSITE signature matches and ProRule-associated functional and structural residues in proteins.». Nucleic Acids Res., 34(Web Server issue), 2006, pàg. W362–365. PMID: 16845026.
- Sigrist CJ, De Castro E, Langendijk-Genevaux PS, Le Saux V, Bairoch A, Hulo N. «ProRule: a new database containing functional and structural information on PROSITE profiles.». Bioinformatics., 21(21), 2005, pàg. 4060–4066. DOI: 10.1093/bioinformatics/bti614. PMID: 16091411.
Enllaços externs
- http://www.expasy.org/prosite/